CREST QCG (solvation shell) not yet run: Debian's xtb 6.7.1 crashes in 'xtb dock'
@ohlincha 已經在處理了。
開始於 2026年11月1日。
評估
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描述
The CREST Solvation Shell run type (QCG, --qcg solvent.xyz --nsolv N --ensemble) is registered and its deck is generated and checked (tests/launch/crest_test.py), but it has never completed: xtb dock, which QCG calls, aborts with a stack-smashing failure (__stack_chk_fail, then segfault) in Debian's xtb 6.7.1, with GFN2 and GFN-FF alike, also when called directly. The result-file names gensub looks for (ensemble/final_ensemble.xyz, final_ensemble.xyz, cluster.xyz, grow/cluster.xyz) come from CREST's documentation, not from a run.
To do: run QCG with an xtb whose docking works (the upstream static release build), confirm the result file names, and say in the help which xtb builds work. Also seen: GFN-FF with SHAKE crashes xtb's MD (the editor disables that combination).
- 主要語言
- C
- 星號
- 10
- 分支
- 8
- 平均合併
- 21 分鐘
- 30 天內合併 PR
- 1
環境準備
這個專案沒有提供開發容器、Dockerfile 或貢獻指南，環境需要你自己搭建：先看它的 README，通用步驟見我們的新手貢獻指南。
從這裡開始
- 先讀完整個 Issue，再讀專案的貢獻指南。
- 在 Issue 下留言說明你要接手 —— 這能避免兩個人做同樣的事。
- Fork 儲存庫，在一個分支上完成修改。
- 送出 Pull Request，並在描述裡引用這個 Issue 編號。
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