CREST QCG (solvation shell) not yet run: Debian's xtb 6.7.1 crashes in 'xtb dock'

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@ohlincha ci sta già lavorando.

Dal 1/11/2026.

Valutazione

Questa issue non è ancora stata valutata.

Descrizione

The CREST Solvation Shell run type (QCG, --qcg solvent.xyz --nsolv N --ensemble) is registered and its deck is generated and checked (tests/launch/crest_test.py), but it has never completed: xtb dock, which QCG calls, aborts with a stack-smashing failure (__stack_chk_fail, then segfault) in Debian's xtb 6.7.1, with GFN2 and GFN-FF alike, also when called directly. The result-file names gensub looks for (ensemble/final_ensemble.xyz, final_ensemble.xyz, cluster.xyz, grow/cluster.xyz) come from CREST's documentation, not from a run.

To do: run QCG with an xtb whose docking works (the upstream static release build), confirm the result file names, and say in the help which xtb builds work. Also seen: GFN-FF with SHAKE crashes xtb's MD (the editor disables that combination).

Lingua principale
C
Stelle
10
Fork
8
Merge medio
21m
PR unite (30g)
1

Preparare l'ambiente

Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.

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