CREST QCG (solvation shell) not yet run: Debian's xtb 6.7.1 crashes in 'xtb dock'
@ohlincha đang làm issue này rồi.
Từ ngày 1/11/2026.
Đánh giá
Issue này chưa được đánh giá.
Mô tả
The CREST Solvation Shell run type (QCG, --qcg solvent.xyz --nsolv N --ensemble) is registered and its deck is generated and checked (tests/launch/crest_test.py), but it has never completed: xtb dock, which QCG calls, aborts with a stack-smashing failure (__stack_chk_fail, then segfault) in Debian's xtb 6.7.1, with GFN2 and GFN-FF alike, also when called directly. The result-file names gensub looks for (ensemble/final_ensemble.xyz, final_ensemble.xyz, cluster.xyz, grow/cluster.xyz) come from CREST's documentation, not from a run.
To do: run QCG with an xtb whose docking works (the upstream static release build), confirm the result file names, and say in the help which xtb builds work. Also seen: GFN-FF with SHAKE crashes xtb's MD (the editor disables that combination).
- Ngôn ngữ chính
- C
- Star
- 10
- Fork
- 8
- Merge trung bình
- 21 phút
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 1
Chuẩn bị môi trường
Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của FriendsofECCE/ECCE
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 76/100
FriendsofECCE/ECCE#717 ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100
FriendsofECCE/ECCE#336 · 1 bình luận ·
-
Aufbau view (#813): staircase layout, use of space, core order, no 'pi system only' for an atomCó thể đã có người làm @ohlincha đã nhận hôm nay. Đang mở
FriendsofECCE/ECCE#817 · 1 người được giao ·
-
Độ khó 4/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100
FriendsofECCE/ECCE#816 ·
-
Windows: uninstalling ECCE takes very longCó thể đã có người làm @ohlincha đã nhận hôm nay. Đang mở
FriendsofECCE/ECCE#815 · 1 người được giao ·
Tất cả issue của FriendsofECCE/ECCE
Issue tương tự
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
cython/cython#8110 · 2 bình luận ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
ai-driven-fuzzing bug claude Minor
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
linagora/open-bastion#425 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
[docs] gravity.md notationsĐang mởquestion
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
-
follow-up Prio 📌
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 84/100
moonbitlang/async#713 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày