CREST QCG (solvation shell) not yet run: Debian's xtb 6.7.1 crashes in 'xtb dock'
@ohlincha y travaille déjà.
Depuis le 1/11/2026.
Évaluation
Cette issue n'a pas encore été évaluée.
Description
The CREST Solvation Shell run type (QCG, --qcg solvent.xyz --nsolv N --ensemble) is registered and its deck is generated and checked (tests/launch/crest_test.py), but it has never completed: xtb dock, which QCG calls, aborts with a stack-smashing failure (__stack_chk_fail, then segfault) in Debian's xtb 6.7.1, with GFN2 and GFN-FF alike, also when called directly. The result-file names gensub looks for (ensemble/final_ensemble.xyz, final_ensemble.xyz, cluster.xyz, grow/cluster.xyz) come from CREST's documentation, not from a run.
To do: run QCG with an xtb whose docking works (the upstream static release build), confirm the result file names, and say in the help which xtb builds work. Also seen: GFN-FF with SHAKE crashes xtb's MD (the editor disables that combination).
- Langage dominant
- C
- Étoiles
- 10
- Forks
- 8
- Merge moyen
- 21 min
- PR mergées (30 j)
- 1
Préparer son environnement
Ce projet ne fournit ni conteneur de développement, ni Dockerfile, ni guide de contribution : l'installation est à votre charge. Commencez par son README, et consultez notre guide de la première contribution pour les étapes générales.
Par où commencer
- Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
- Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
- Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
- Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.
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