Refactor Xenium + Visium paths and use better names
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 3/5
- Thời gian dự kiến
- 1-2 ngày
- Mức phù hợp với người mới
- 45/100
- Loại issue
- Tái cấu trúc
- Độ rõ ràng
- Đặc tả rõ ràng
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Công nghệ
- jupyter-notebook, python
- Lĩnh vực
- documentation
Hướng nghiên cứu
Bắt đầu với các đường dẫn trong 00_xenium_and_visium.ipynb, 01_xenium_and_visium.ipynb và 02_xenium_and_visium.ipynb, sau đó xem xét config.py nên lưu trữ chúng như thế nào. Cập nhật các notebook để sử dụng manual_annotations.zarr thay cho sandbox.zarr và xác minh rằng tất cả các đường dẫn đều được tập trung hóa, đồng thời bản sao S3 đã được đổi tên được tham chiếu.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
- all the paths used in notebooks
00_xenium_and_visium.ipynb,01_xenium_and_visium.ipynband02_xenium_and_visium.ipynbshould be placed in aconfig.pyfile -
sandbox.zarrwas a poorly chosen name, rename it tomanual_annotations.zarr. I have already made a copy in the S3 bucket of that file (so that now bothsandbox.zarr.zipandmanual_annotations.zarr.zipare present), so one needs just to adjust the notebooks.
- Ngôn ngữ chính
- Jupyter Notebook
- Star
- 67
- Fork
- 26
- Merge trung bình
- 4 phút
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 1
Hướng dẫn đóng góp
Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của scverse/spatialdata-tutorials
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 45/100
scverse/spatialdata-tutorials#150 · 1 bình luận ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 55/100
scverse/spatialdata-tutorials#146 · 1 reaction ·
-
Intro notebook not in docs Đang mở
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
scverse/spatialdata-tutorials#137 ·
-
Update Xenium dataset Đang mở
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
scverse/spatialdata-tutorials#110 ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100
scverse/spatialdata-tutorials#106 ·
Tất cả issue của scverse/spatialdata-tutorials
Issue tương tự
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100
-
certification
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 80/100
-
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 85/100
bisq-network/support#2181 ·
-
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 85/100
-
tutorial updates Đang mở
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 80/100
sveltejs/svelte.dev#2241 ·