Update Xenium dataset

Đang mở

#110 mở ngày 31/7/2024 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó: 3/5
Thời gian dự kiến: 1-2 ngày
Mức phù hợp với người mới: 35/100

Loại issue: Tài liệu
Độ rõ ràng: Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động: Đình trệ
Công nghệ: jupyter-notebook
Lĩnh vực: data, documentation

Hướng nghiên cứu

Tìm notebook Xenium và kiểm tra cách dataset XOA 2.0 hiện tại được tham chiếu. So sánh các dataset 10x được liên kết và xác định nên sử dụng một trong số đó hay chờ dữ liệu panel 5K ổn định; hoàn tất nghĩa là notebook sử dụng dataset đã chọn và vẫn chạy thành công.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

The Xenium notebook is using a previous dataset (for XOA 2.0). We should consider using on the following recent datasets, recommended by the 10x team:

In alternative we could use the preview data for the 5K panel:

Preview Data: FFPE Human Lymph Node with 5K Pan Tissue and Pathways Panel

Or even better,

wait until a stable version of the 5K panel data is released and use that.

Ngôn ngữ chính: Jupyter Notebook
Star: 67
Fork: 26
Merge trung bình: 4 phút
Pull request đã merge (30 ngày): 1

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Bắt đầu từ đâu

Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của scverse/spatialdata-tutorials

speed_up_illustration.ipynb notebook plots all the intermediate plots Đang mở

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 45/100

scverse/spatialdata-tutorials#150 · 1 bình luận · Mở ngày 15/8/2025
Confusion of labels and images in labels_shapes_interchangeability.ipynb Đang mở

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 55/100

scverse/spatialdata-tutorials#146 · 1 reaction · Mở ngày 13/7/2025
Intro notebook not in docs Đang mở

Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

scverse/spatialdata-tutorials#137 · Mở ngày 15/3/2025
Check reproducibility of Steinbock and NanoString notebooks on Windows Đang mở

Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100

scverse/spatialdata-tutorials#106 · Mở ngày 16/7/2024
Replace `os.path` with `Path` and "unzip" with `shutil.unpack_archive` Đang mở

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 30/100

scverse/spatialdata-tutorials#40 · 1 bình luận · Mở ngày 28/6/2023

Tất cả issue của scverse/spatialdata-tutorials

Issue tương tự

OGS AmBe example has no source.timing block, so every event sits at time zero Đang mở

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100

lanl/ScintiPix#61 · Mở ngày 24/9/2026
anls_compute measures distance on normalized strings but divides by raw length, so whitespace-padded predictions score near 1.0 on DocVQA/InfoVQA/WildDoc Đang mở

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100

open-compass/VLMEvalKit#1705 · Mở ngày 23/9/2026
Support FITS files with "microns" wavelength unit Đang mở

Feature Request units

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100

spacetelescope/synphot_refactor#447 · 2 bình luận · Mở ngày 23/9/2026
Adjust the cohort counts dissemination - only include cohorts in the manifest Đang mở

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100

OHDSI/Picard#129 · Mở ngày 23/9/2026
get_macro_indicators: "Change over window" spans an implicit, variable period — reads as y/y on monthly series Đang mở

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100

TauricResearch/TradingAgents#1397 · Mở ngày 23/9/2026

Thêm issue về Data Engineering