Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

Chủ sở hữu

ncbi

Đăng nhập để theo dõi

Đã lập chỉ mục 11 kho mã nguồn · Xem trên GitHub

Phù hợp cho người mới Tất cả
Đang mở Tất cả

Các issue có thể đã có người làm được xếp cuối danh sách. Sắp xếp tất cả theo ngày

  • check-corrupt exits 0 on corrupt runs since 3.3.0 and reports "All accessions are good!" for inputs it could not open
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 68/100

    ncbi/sra-tools#1202 ·

  • [BUG] pgap.py exits 0 without running the pipeline when its self-update fails or rewrites the script
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 88/100

    ncbi/pgap#361 ·

  • Proteins are not found for Nymphaea taxid during EGAPx annotation
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    ncbi/egapx#271 · 1 bình luận ·

  • Segfault in ReferenceObj_Read when a reference's row can't be read before any other
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 88/100

    ncbi/ncbi-vdb#282 · 1 bình luận ·

  • Segfault in readNormalIncomplete: RefSeq load() sets the reader after starting the background loading thread
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    ncbi/ncbi-vdb#280 · 1 bình luận ·

  • BUG: changing limits from docker container
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 52/100

    ncbi/egapx#270 ·

  • README correcting request.
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100

    ncbi/egapx#269 · 1 bình luận ·

  • prefetch/srapath "no data (404)" for all runs in approved dbGaP cart (phs000951, project #43272)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    ncbi/sra-tools#1200 · 1 bình luận ·

  • lds2_indexer not found during rnaseq_collapse
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 52/100

    ncbi/egapx#267 · 1 bình luận ·

  • Segmentation fault in rnaseq_collapse_new
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    ncbi/egapx#264 · 1 bình luận ·

  • Fetch genes by assembly ID OR fetch genome annotation report using the CLI
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    ncbi/datasets#600 · 2 bình luận ·

  • How to increase parallelism of minimap2_wnode_fasta in EGAPx?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    ncbi/egapx#263 · 3 bình luận ·

  • Huge genome annotation issue
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 38/100

    ncbi/egapx#262 · 32 bình luận ·

  • COBALT: CMultiAligner::x_BuildAlignmentIterative double frees constraint hits when the alignment stage throws anything other than std::bad_alloc
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 88/100

    ncbi/ncbi-cxx-toolkit-public#25 · 1 bình luận ·

  • Inconsistent host annotation for ON022733.1 in datasets CLI and NCBI website
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    ncbi/datasets#595 · 5 bình luận · 1 reaction ·

  • datasets summary virus genome taxon 10239 fails on gateway errors
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    ncbi/datasets#594 · 4 bình luận ·

  • Negative hmm scores throw an error in amr_report.cpp
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 68/100

    ncbi/amr#192 · 2 bình luận ·

  • amr_report crashes with "QC_ASSERT hmmStart" when multiple overlapping NCBIFAM HMM hits exist for a single protein (v4.2.7)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    ncbi/amr#191 · 1 bình luận ·

  • cmake acting weird
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    ncbi/sra-tools#1182 ·

  • Local SRA read cache isn't relocatable — read paths in sra_dir/runs.yaml are stored as absolute paths
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    ncbi/egapx#257 · 1 bình luận ·

  • rnaseq_collapse fails with a CStringException::eConvert error
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    ncbi/egapx#256 · 9 bình luận ·

  • Add metadata column to distinguish patent sequences (e.g. include Genbank division)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    ncbi/datasets#586 · 1 bình luận ·

  • On the masking step
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    ncbi/egapx#253 · 3 bình luận ·

  • Newer nextflow version (26.04.x) import errors
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100

    ncbi/egapx#251 · 3 bình luận ·

  • Memory Configuration Issues for Large Genomes
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100

    ncbi/egapx#250 · 6 bình luận ·

  • star_wnode writes ~5.5 TB of temporary files to disk when TMPDIR is set in slurm.config
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100

    ncbi/egapx#249 · 9 bình luận ·

  • Segmentation fault in rnaseq_collapse
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 28/100

    ncbi/egapx#246 · 9 bình luận ·

  • ‌Arabidopsis thaliana rnaseq_collapse Segmentation fault
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    ncbi/egapx#245 · 6 bình luận ·

  • filter by segmant
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    ncbi/datasets#578 · 3 bình luận ·

  • please do reactive python binding via anywidget
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 30/100

    ncbi/icn3d#129 · 3 bình luận ·

  • Download genome as part of Offline mode?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    ncbi/egapx#220 · 1 bình luận ·

  • Isoform nomenclature question
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    ncbi/egapx#217 · 5 bình luận ·

  • fasterq-dump incomplete download
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100

    ncbi/sra-tools#1154 ·

  • Enhancement request: Support multi-host and host-exclusion filtering in NCBI Datasets CLI (viral genomes)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    ncbi/datasets#559 · 1 bình luận ·

  • Date ranges (e.g., 2014/2019) are incorrectly parsed as single year in metadata
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100

    ncbi/datasets#557 · 2 bình luận ·

  • Compilation error due to missing file
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 65/100

    ncbi/sra-tools#1122 · 3 bình luận · 1 reaction ·

  • support for gene_type
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    ncbi/datasets#544 · 2 bình luận ·

  • Best practices for batch processing SRA accessions on an HPC cluster
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 20/100

    ncbi/sra-tools#1113 ·

  • fasterq-dump error code 3 associated with directory name
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    ncbi/sra-tools#1110 ·

  • windowmasker reads from a file called `-` instead of from `stdin`.
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100

    ncbi/ncbi-cxx-toolkit-public#21 · 7 bình luận ·

  • Use of RNA-seq strand information in EGAPX pipeline
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100

    ncbi/egapx#172 · 12 bình luận ·

  • BUG: Treats local read files as SRR, if it supplied as path to read list.
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    reads error

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    ncbi/egapx#165 · 19 bình luận ·

  • Author lists do not deduplicate authors with differing numbers of initials
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    ncbi/datasets#508 · 1 bình luận ·

  • Build fails on ARM windows 11 with "No matching toolchains found for types: @@aspect_bazel_lib+//lib:copy_to_directory_toolchain_type"
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    ncbi/datasets#496 · 3 bình luận ·

  • Please add --released-before to `datasets download virus genome taxon`
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    ncbi/datasets#489 · 1 bình luận · 1 reaction ·

  • Does latf-load not support single-cell RNA-seq data, including index files?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100

    ncbi/sra-tools#1048 · 2 bình luận ·

  • `datasets summary genome taxon` should have exitcode of `0` when there are no genomes for a valid taxon
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 42/100

    ncbi/datasets#482 · 5 bình luận · 2 reaction ·

  • configure assumes /usr/bin/make is gmake, and thus make fails on a system where it isn't
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 38/100

    ncbi/ncbi-vdb#176 · 6 bình luận ·

  • v1.0.31 binary shared object issue
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    ncbi/stxtyper#12 · 7 bình luận ·

  • found incorrect/missing assembly_link_type
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 48/100

    ncbi/datasets#436 · 1 bình luận ·

Đang hiển thị 100 mục mới nhất

Trang này chỉ liệt kê những gì được lập chỉ mục gần đây. Bộ lọc nâng cao có toàn bộ kho, thu hẹp theo ngôn ngữ, độ khó và thời lượng.

Mở bộ lọc nâng cao

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.