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• Proteins are not found for Nymphaea taxid during EGAPx annotation

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  ncbi/egapx#271 · Abierto el 26/9/2026

• Segfault in ReferenceObj_Read when a reference's row can't be read before any other

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  ncbi/ncbi-vdb#282 · 1 comentario · Abierto el 25/9/2026

• Segfault in readNormalIncomplete: RefSeq load() sets the reader after starting the background loading thread

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  ncbi/ncbi-vdb#280 · 1 comentario · Abierto el 25/9/2026

• BUG: changing limits from docker container

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  ncbi/egapx#270 · Abierto el 21/9/2026

• README correcting request.

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  ncbi/egapx#269 · 1 comentario · Abierto el 19/9/2026

• prefetch/srapath "no data (404)" for all runs in approved dbGaP cart (phs000951, project #43272)

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  ncbi/sra-tools#1200 · 1 comentario · Abierto el 4/9/2026

• lds2_indexer not found during rnaseq_collapse

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  ncbi/egapx#267 · 1 comentario · Abierto el 4/9/2026

• Segmentation fault in rnaseq_collapse_new

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  ncbi/egapx#264 · 1 comentario · Abierto el 19/8/2026

• Fetch genes by assembly ID OR fetch genome annotation report using the CLI

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  ncbi/datasets#600 · 2 comentarios · Abierto el 16/8/2026

• How to increase parallelism of minimap2_wnode_fasta in EGAPx?

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  ncbi/egapx#263 · 3 comentarios · Abierto el 8/8/2026

• Huge genome annotation issue

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  ncbi/egapx#262 · 16 comentarios · Abierto el 4/8/2026

• COBALT: CMultiAligner::x_BuildAlignmentIterative double frees constraint hits when the alignment stage throws anything other than std::bad_alloc

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  Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 88/100

  ncbi/ncbi-cxx-toolkit-public#25 · 1 comentario · Abierto el 3/8/2026

• Inconsistent host annotation for ON022733.1 in datasets CLI and NCBI website

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  ncbi/datasets#595 · 5 comentarios · 1 reacción · Abierto el 28/7/2026

• datasets summary virus genome taxon 10239 fails on gateway errors

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  ncbi/datasets#594 · 4 comentarios · Abierto el 23/7/2026

• Negative hmm scores throw an error in amr_report.cpp

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  ncbi/amr#192 · 2 comentarios · Abierto el 29/6/2026

• amr_report crashes with "QC_ASSERT hmmStart" when multiple overlapping NCBIFAM HMM hits exist for a single protein (v4.2.7)

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  ncbi/amr#191 · 1 comentario · Abierto el 19/6/2026

• cmake acting weird

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  ncbi/sra-tools#1182 · Abierto el 18/6/2026

• Local SRA read cache isn't relocatable — read paths in sra_dir/runs.yaml are stored as absolute paths

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  ncbi/egapx#257 · 1 comentario · Abierto el 18/6/2026

• rnaseq_collapse fails with a CStringException::eConvert error

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  ncbi/egapx#256 · 9 comentarios · Abierto el 15/6/2026

• Add metadata column to distinguish patent sequences (e.g. include Genbank division)

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  ncbi/datasets#586 · 1 comentario · Abierto el 11/6/2026

• On the masking step

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  ncbi/egapx#253 · 3 comentarios · Abierto el 5/6/2026

• Newer nextflow version (26.04.x) import errors

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  ncbi/egapx#251 · 3 comentarios · Abierto el 2/6/2026

• Memory Configuration Issues for Large Genomes

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  ncbi/egapx#250 · 6 comentarios · Abierto el 1/6/2026

• star_wnode writes ~5.5 TB of temporary files to disk when TMPDIR is set in slurm.config

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  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 78/100

  ncbi/egapx#249 · 9 comentarios · Abierto el 29/5/2026

• Segmentation fault in rnaseq_collapse

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  ncbi/egapx#246 · 9 comentarios · Abierto el 14/5/2026

• ‌Arabidopsis thaliana rnaseq_collapse Segmentation fault

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  ncbi/egapx#245 · 6 comentarios · Abierto el 12/5/2026

• filter by segmant

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  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 48/100

  ncbi/datasets#578 · 3 comentarios · Abierto el 11/5/2026

• please do reactive python binding via anywidget

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  ncbi/icn3d#129 · 3 comentarios · Abierto el 16/4/2026

• Download genome as part of Offline mode?

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  ncbi/egapx#220 · 1 comentario · Abierto el 8/4/2026

• Isoform nomenclature question

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  ncbi/egapx#217 · 5 comentarios · Abierto el 24/3/2026

• fasterq-dump incomplete download

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  ncbi/sra-tools#1154 · Abierto el 27/2/2026

• Enhancement request: Support multi-host and host-exclusion filtering in NCBI Datasets CLI (viral genomes)

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  ncbi/datasets#559 · 1 comentario · Abierto el 29/1/2026

• Date ranges (e.g., 2014/2019) are incorrectly parsed as single year in metadata

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  ncbi/datasets#557 · 2 comentarios · Abierto el 26/1/2026

• Compilation error due to missing file

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  ncbi/sra-tools#1122 · 3 comentarios · 1 reacción · Abierto el 4/12/2025

• support for gene_type

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  ncbi/datasets#544 · 2 comentarios · Abierto el 1/12/2025

• Best practices for batch processing SRA accessions on an HPC cluster

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  ncbi/sra-tools#1113 · Abierto el 1/11/2025

• fasterq-dump error code 3 associated with directory name

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  ncbi/sra-tools#1110 · Abierto el 22/10/2025

• windowmasker reads from a file called `-` instead of from `stdin`.

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  ncbi/ncbi-cxx-toolkit-public#21 · 7 comentarios · Abierto el 19/9/2025

• Use of RNA-seq strand information in EGAPX pipeline

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  ncbi/egapx#172 · 12 comentarios · Abierto el 8/9/2025

• BUG: Treats local read files as SRR, if it supplied as path to read list.

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  ncbi/egapx#165 · 19 comentarios · Abierto el 25/8/2025

• Author lists do not deduplicate authors with differing numbers of initials

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  ncbi/datasets#508 · 1 comentario · Abierto el 24/6/2025

• Build fails on ARM windows 11 with "No matching toolchains found for types: @@aspect_bazel_lib+//lib:copy_to_directory_toolchain_type"

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  ncbi/datasets#496 · 3 comentarios · Abierto el 27/5/2025

• Please add --released-before to `datasets download virus genome taxon`

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  ncbi/datasets#489 · 1 comentario · 1 reacción · Abierto el 20/5/2025

• Does latf-load not support single-cell RNA-seq data, including index files?

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  ncbi/sra-tools#1048 · 2 comentarios · Abierto el 12/5/2025

• `datasets summary genome taxon` should have exitcode of `0` when there are no genomes for a valid taxon

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  ncbi/datasets#482 · 5 comentarios · 2 reacciones · Abierto el 8/5/2025

• configure assumes /usr/bin/make is gmake, and thus make fails on a system where it isn't

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  ncbi/ncbi-vdb#176 · 6 comentarios · Abierto el 18/2/2025

• v1.0.31 binary shared object issue

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  ncbi/stxtyper#12 · 7 comentarios · Abierto el 22/1/2025

• found incorrect/missing assembly_link_type

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  ncbi/datasets#436 · 1 comentario · Abierto el 10/12/2024

• Support for non-Refseq genes

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

  ncbi/datasets#434 · 1 comentario · 1 reacción · Abierto el 6/12/2024

• Include corresponding gca/gcf accession in the metadata of each sample

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  ncbi/datasets#433 · 5 comentarios · 1 reacción · Abierto el 5/12/2024