Hacktoberfest 2026：メンテナが10月に向けて印を付けた、オープンで初心者向けの issue。 Hacktoberfest の issue を見る

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誰かが対応中かもしれないイシューは最後に並べています。 すべて日付順に表示

  • check-corrupt exits 0 on corrupt runs since 3.3.0 and reports "All accessions are good!" for inputs it could not open
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 68/100

    ncbi/sra-tools#1202 ·

  • Proteins are not found for Nymphaea taxid during EGAPx annotation
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    ncbi/egapx#271 ·

  • Segfault in ReferenceObj_Read when a reference's row can't be read before any other
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 88/100

    ncbi/ncbi-vdb#282 · コメント 1 件 ·

  • Segfault in readNormalIncomplete: RefSeq load() sets the reader after starting the background loading thread
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

    ncbi/ncbi-vdb#280 · コメント 1 件 ·

  • BUG: changing limits from docker container
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 52/100

    ncbi/egapx#270 ·

  • README correcting request.
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 72/100

    ncbi/egapx#269 · コメント 1 件 ·

  • prefetch/srapath "no data (404)" for all runs in approved dbGaP cart (phs000951, project #43272)
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

    ncbi/sra-tools#1200 · コメント 1 件 ·

  • lds2_indexer not found during rnaseq_collapse
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 52/100

    ncbi/egapx#267 · コメント 1 件 ·

  • Segmentation fault in rnaseq_collapse_new
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    ncbi/egapx#264 · コメント 1 件 ·

  • Fetch genes by assembly ID OR fetch genome annotation report using the CLI
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 48/100

    ncbi/datasets#600 · コメント 2 件 ·

  • How to increase parallelism of minimap2_wnode_fasta in EGAPx?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

    ncbi/egapx#263 · コメント 3 件 ·

  • Huge genome annotation issue
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 38/100

    ncbi/egapx#262 · コメント 16 件 ·

  • COBALT: CMultiAligner::x_BuildAlignmentIterative double frees constraint hits when the alignment stage throws anything other than std::bad_alloc
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 1/5 1時間未満 初心者へのやさしさ 88/100

    ncbi/ncbi-cxx-toolkit-public#25 · コメント 1 件 ·

  • Inconsistent host annotation for ON022733.1 in datasets CLI and NCBI website
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 48/100

    ncbi/datasets#595 · コメント 5 件 · リアクション 1 件 ·

  • datasets summary virus genome taxon 10239 fails on gateway errors
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 48/100

    ncbi/datasets#594 · コメント 4 件 ·

  • Negative hmm scores throw an error in amr_report.cpp
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 68/100

    ncbi/amr#192 · コメント 2 件 ·

  • amr_report crashes with "QC_ASSERT hmmStart" when multiple overlapping NCBIFAM HMM hits exist for a single protein (v4.2.7)
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 48/100

    ncbi/amr#191 · コメント 1 件 ·

  • cmake acting weird
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

    ncbi/sra-tools#1182 ·

  • Local SRA read cache isn't relocatable — read paths in sra_dir/runs.yaml are stored as absolute paths
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    ncbi/egapx#257 · コメント 1 件 ·

  • rnaseq_collapse fails with a CStringException::eConvert error
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

    ncbi/egapx#256 · コメント 9 件 ·

  • Add metadata column to distinguish patent sequences (e.g. include Genbank division)
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

    ncbi/datasets#586 · コメント 1 件 ·

  • On the masking step
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    ncbi/egapx#253 · コメント 3 件 ·

  • Newer nextflow version (26.04.x) import errors
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 55/100

    ncbi/egapx#251 · コメント 3 件 ·

  • Memory Configuration Issues for Large Genomes
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

    ncbi/egapx#250 · コメント 6 件 ·

  • star_wnode writes ~5.5 TB of temporary files to disk when TMPDIR is set in slurm.config
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 78/100

    ncbi/egapx#249 · コメント 9 件 ·

  • Segmentation fault in rnaseq_collapse
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 28/100

    ncbi/egapx#246 · コメント 9 件 ·

  • ‌Arabidopsis thaliana rnaseq_collapse Segmentation fault
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    ncbi/egapx#245 · コメント 6 件 ·

  • filter by segmant
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

    ncbi/datasets#578 · コメント 3 件 ·

  • please do reactive python binding via anywidget
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 30/100

    ncbi/icn3d#129 · コメント 3 件 ·

  • Download genome as part of Offline mode?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 48/100

    ncbi/egapx#220 · コメント 1 件 ·

  • Isoform nomenclature question
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100

    ncbi/egapx#217 · コメント 5 件 ·

  • fasterq-dump incomplete download
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

    ncbi/sra-tools#1154 ·

  • Enhancement request: Support multi-host and host-exclusion filtering in NCBI Datasets CLI (viral genomes)
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

    ncbi/datasets#559 · コメント 1 件 ·

  • Date ranges (e.g., 2014/2019) are incorrectly parsed as single year in metadata
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 55/100

    ncbi/datasets#557 · コメント 2 件 ·

  • Compilation error due to missing file
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 65/100

    ncbi/sra-tools#1122 · コメント 3 件 · リアクション 1 件 ·

  • support for gene_type
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    ncbi/datasets#544 · コメント 2 件 ·

  • Best practices for batch processing SRA accessions on an HPC cluster
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 20/100

    ncbi/sra-tools#1113 ·

  • fasterq-dump error code 3 associated with directory name
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    ncbi/sra-tools#1110 ·

  • windowmasker reads from a file called `-` instead of from `stdin`.
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 55/100

    ncbi/ncbi-cxx-toolkit-public#21 · コメント 7 件 ·

  • Use of RNA-seq strand information in EGAPX pipeline
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    ncbi/egapx#172 · コメント 12 件 ·

  • BUG: Treats local read files as SRR, if it supplied as path to read list.
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    reads error

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

    ncbi/egapx#165 · コメント 19 件 ·

  • Author lists do not deduplicate authors with differing numbers of initials
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

    ncbi/datasets#508 · コメント 1 件 ·

  • Build fails on ARM windows 11 with "No matching toolchains found for types: @@aspect_bazel_lib+//lib:copy_to_directory_toolchain_type"
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    ncbi/datasets#496 · コメント 3 件 ·

  • Please add --released-before to `datasets download virus genome taxon`
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

    ncbi/datasets#489 · コメント 1 件 · リアクション 1 件 ·

  • Does latf-load not support single-cell RNA-seq data, including index files?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    ncbi/sra-tools#1048 · コメント 2 件 ·

  • `datasets summary genome taxon` should have exitcode of `0` when there are no genomes for a valid taxon
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 42/100

    ncbi/datasets#482 · コメント 5 件 · リアクション 2 件 ·

  • configure assumes /usr/bin/make is gmake, and thus make fails on a system where it isn't
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 38/100

    ncbi/ncbi-vdb#176 · コメント 6 件 ·

  • v1.0.31 binary shared object issue
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100

    ncbi/stxtyper#12 · コメント 7 件 ·

  • found incorrect/missing assembly_link_type
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 48/100

    ncbi/datasets#436 · コメント 1 件 ·

  • Support for non-Refseq genes
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 20/100

    ncbi/datasets#434 · コメント 1 件 · リアクション 1 件 ·

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