Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

Chủ sở hữu

OpenMS

Đăng nhập để theo dõi

Đã lập chỉ mục 1 kho mã nguồn · Xem trên GitHub

Phù hợp cho người mới Tất cả
Đang mở Tất cả

Các issue có thể đã có người làm được xếp cuối danh sách. Sắp xếp tất cả theo ngày

  • MSstatsFile: Condition written unquoted, so conditions containing commas produce malformed MSstats CSV
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    new contributor

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 65/100

    OpenMS/OpenMS#10512 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Benchmark ProSE fragment index serialization/rebuilding across compute nodes versus all work on one node
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    Performance

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 8/100

    OpenMS/OpenMS#10488 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • RFC: Decouple acquisition-data readers from OpenMS models and add zero-copy access to decoded buffers (not urgent)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    OpenMS/OpenMS#10413 · 3 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Deploying versioned OpenMS libraries (SOVERSION): what has to ship where, and what breaks
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 38/100

    OpenMS/OpenMS#10369 · 6 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • [FEATURE] Deploying tools built against the developer SDK: openms_install_runtime(), third-party licenses in the SDK, and a deployment check
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    OpenMS/OpenMS#10341 · 6 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Segfault in QTClusterFinder/FeatureGroupingAlgorithmQT during ProteomicsLFQ cross-run alignment with Sage identifications
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 52/100

    OpenMS/OpenMS#10310 · 2 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • BrukerTimsFile: read .d.zip archives without unpacking analysis.tdf_bin
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    OpenMS/OpenMS#10281 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Move the vcpkg OpenSSL pin off 3.6 before its support ends on 2026-11-01
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    OpenMS/OpenMS#10270 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • 3.6.0 blockers with verified fixes: macOS ExecutePipeline lacks bin/qt.conf; pyOpenMS plot_spectrum and get_df(long=True) regressions
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    blocker

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    OpenMS/OpenMS#10260 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Tracking: finish the third-party dependency consolidation (follow-up to #9451)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    OpenMS/OpenMS#10251 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Support satellite ions (d, v, w) — currently an mzPAF v1.0 conformance gap
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement OpenMS - library

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 67/100

    OpenMS/OpenMS#10175 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Add mzSpecLib (HUPO-PSI spectral library standard) read/write support
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement File Format

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    OpenMS/OpenMS#10172 · 3 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • CI: no Windows Debug build is exercised (windows-x64-debug preset is untested)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    OpenMS/OpenMS#10145 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • vcpkg: derive VCPKG_MANIFEST_FEATURES from the WITH_* options instead of requiring both
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 64/100

    OpenMS/OpenMS#10143 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Boolean string parameters: valid-string order `{"true","false"}` vs `{"false","true"}` is used inconsistently and silently changes flag/CTD/CWL behavior
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    usability

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    OpenMS/OpenMS#10116 · 4 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • MS1-labeled data: keep the spectrum match truthful, make peptide identity explicit
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    OpenMS/OpenMS#10062 · 5 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • check if this is compatible with our current version
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100

    OpenMS/OpenMS#10060 · 3 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • AASequence cannot represent an unlocalised modification (position unknown)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    OpenMS/OpenMS#10016 · 4 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • [FEATUREFINDER] Biosaur2Algorithm::centroidProfileSpectra_: dead drift-time guard would drop every FAIMS CV
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    defect

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100

    OpenMS/OpenMS#10005 · 3 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • check if TMT and LFQ quantification works with NuXL output
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    OpenMS/OpenMS#9992 · 2 bình luận · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • ProteomicsLFQ: single-threaded workflow does not scale to large run counts (500-run LFQ → ~28 h, 700+ GB, 1 core)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 42/100

    OpenMS/OpenMS#9977 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Windows: file paths longer than MAX_PATH (260 chars) are not supported
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 38/100

    OpenMS/OpenMS#9943 · 5 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Nightly build producing void outputs
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    new contributor question

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 40/100

    OpenMS/OpenMS#9925 · 4 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • ConsensusID -keep_old_scores: per-engine scores are lost, and the obvious one-line fix makes it worse
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 52/100

    OpenMS/OpenMS#9894 · 4 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • QPX scan column: Bruker TDF, Sciex WIFF and merged PASEF native IDs do not identify the spectrum
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 45/100

    OpenMS/OpenMS#9893 · 2 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • QPX: intensity provenance, the replicate axis, and dataset self-sufficiency (Phase 2 + 3 of #9864)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    OpenMS/OpenMS#9885 · 2 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Isobaric PSM roll-up sums every PSM with no purity filter, and the per-PSM purity it already stores is never used
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    OpenMS/OpenMS#9870 · 2 bình luận · 1 reaction · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • OpenNuXL: nondeterministic fragment ion annotation for near-mass-degenerate theoretical peaks
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    OpenMS/OpenMS#9858 · 1 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • ExperimentalDesign cannot express two multiplexing dimensions (SILAC inside TMT), and the QPX guard for it is untested
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    OpenMS/OpenMS#9840 · 4 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • UniPEFF should report isoforms
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement new contributor

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 45/100

    OpenMS/OpenMS#9830 · 3 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • QPX export: active follow-up tracker
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    OpenMS/OpenMS#9817 · 14 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Feature::getConvexHull() turns mixed empty/non-empty hulls into a full numeric-range bounding box
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 52/100

    OpenMS/OpenMS#9802 · 4 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • CI: flaky "Failed to download thermofisher.commoncore.*.nupkg" breaks openms-ci-full builds
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    OpenMS/OpenMS#9717 · 2 bình luận · 1 reaction · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • OpenSwathWorkflow: featureXML output order is not deterministic across -threads (wave scheduler)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 76/100

    OpenMS/OpenMS#9628 · 4 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • [RFC] Spatial feature detection for imaging MS (with optional ion mobility)
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    OpenMS/OpenMS#9433 · 5 bình luận · 1 reaction · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • ThermoRawFile should support PeakFileOptions
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    OpenMS/OpenMS#9427 · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Add chimeric search to ProSE
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 30/100

    OpenMS/OpenMS#9422 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • [aw] No-Op Runs
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    agentic-workflows

    Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 5/100

    OpenMS/OpenMS#9402 · 2 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Parquet IO: improve ProteinIdentification identifier architecture
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    OpenMS/OpenMS#9401 · 1 bình luận · 1 reaction · 2 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • digest of sequence with X might lead to unexpected result
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    OpenMS/OpenMS#9303 · 5 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Try build optimizations with Copilot by Microsoft
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    OpenMS/OpenMS#9282 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • ProSE chunked calibration: pool PSMs across first-K main-search chunks to close residual yield gap
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    OpenMS/OpenMS#9184 · 1 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Investigate how easy it is to implement DDA+ in PeptideDatabaseSearchFI
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    OpenMS/OpenMS#9107 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Feature request: Chimeric spectrum detection / co-isolation enumeration in pyopenms
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    OpenMS/OpenMS#9004 · 2 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • FFID: address redundant elution model fitting, background subtraction, and score evaluation
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    OpenMS/OpenMS#8886 · 2 bình luận · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Investigate loss of AVX support on Windows
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    OpenMS/OpenMS#8845 · 3 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Add tests for large datasets (e.g. run regularly)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    OpenMS/OpenMS#8788 · 128 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Evaluate new alignment method
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    OpenMS/OpenMS#8746 · 33 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • TOPPAS to CWL Converter
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 38/100

    OpenMS/OpenMS#7710 · 4 bình luận · 2 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • incomplete error message about JSON input error
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 40/100

    OpenMS/OpenMS#7708 · 2 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.