results.h5: store scans and trajectories (energy and geometry per point), so examples can drop large outputs

Đang mở
#883 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
4/5
Thời gian dự kiến
3-5 ngày
Mức phù hợp với người mới
35/100
Loại issue
Tính năng
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Sôi nổi
Công nghệ
c
Lĩnh vực
data

Hướng nghiên cứu

Read the existing results.h5 layout and its TREXIO-style naming, then trace how the job store and ecce-results write save results. Identify how the scan, geometry-trace, and MD panels currently read parsed properties, and check the H₂ potential curve example (#858) for the data it needs. Done means /trace stores per-point coordinates and energy, with scan coordinate and optional gradient and cell, and those panels can read it; the issue marks this work as low priority.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

Today results.h5 holds one geometry's basis, MOs and density; a scan's energies and geometries per point (SCANCOORD, SCANENERGY, GEOMTRACE) and an optimisation or MD trace live only in ECCE's parsed properties, and the raw output has to be kept for re-parsing. Example: the H₂ potential curve (#858) is 26 MB of ORCA output for five scans, mostly the orbitals and gradient printed at every step.

Wanted: a /trace group in results.h5 (TREXIO-style naming as the rest of the file): per point the coordinates, energy, scan coordinate value, and optionally gradient and cell; written by the job store and ecce-results write, read by the scan, geometry-trace and MD panels. Then an example can ship results.h5 plus the small parsed properties instead of the full output.

Low priority (back burner).

Ngôn ngữ chính
C
Star
10
Fork
8
Merge trung bình
21 phút
Pull request đã merge (30 ngày)
1

Chuẩn bị môi trường

Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của FriendsofECCE/ECCE

Tất cả issue của FriendsofECCE/ECCE

Issue tương tự

Thêm issue về C

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.