results.h5: store scans and trajectories (energy and geometry per point), so examples can drop large outputs

オープン
#883 コメント 0 件 リアクション 0 件 担当者 0 名 GitHub で見る

まだ誰も着手していません。

評価

難易度
4/5
見積もり時間
3〜5日
初心者へのやさしさ
35/100
issue の種類
機能追加
明瞭さ
おおむね明確
活発さ
活発
技術スタック
c
領域
data

調査の方向性

Read the existing results.h5 layout and its TREXIO-style naming, then trace how the job store and ecce-results write save results. Identify how the scan, geometry-trace, and MD panels currently read parsed properties, and check the H₂ potential curve example (#858) for the data it needs. Done means /trace stores per-point coordinates and energy, with scan coordinate and optional gradient and cell, and those panels can read it; the issue marks this work as low priority.

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

説明

Today results.h5 holds one geometry's basis, MOs and density; a scan's energies and geometries per point (SCANCOORD, SCANENERGY, GEOMTRACE) and an optimisation or MD trace live only in ECCE's parsed properties, and the raw output has to be kept for re-parsing. Example: the H₂ potential curve (#858) is 26 MB of ORCA output for five scans, mostly the orbitals and gradient printed at every step.

Wanted: a /trace group in results.h5 (TREXIO-style naming as the rest of the file): per point the coordinates, energy, scan coordinate value, and optionally gradient and cell; written by the job store and ecce-results write, read by the scan, geometry-trace and MD panels. Then an example can ship results.h5 plus the small parsed properties instead of the full output.

Low priority (back burner).

主要言語
C
スター
10
フォーク
8
平均マージ
21分
マージ済み PR(30日)
1

環境構築

このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

FriendsofECCE/ECCE のほかの issue

FriendsofECCE/ECCE の issue をすべて見る

似ている issue

C の issue をもっと見る

新しい issue をメールで受け取る

初心者向けの GitHub issue を短くまとめたダイジェスト。