results.h5: store scans and trajectories (energy and geometry per point), so examples can drop large outputs

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Bewertung

Schwierigkeit
4/5
Geschätzter Aufwand
3-5 Tage
Anfängerfreundlichkeit
35/100
Issue-Typ
Feature
Klarheit
Größtenteils klar
Aktivitätsstatus
Aktiv
Tech-Stack
c
Bereich
data

Rechercherichtung

Read the existing results.h5 layout and its TREXIO-style naming, then trace how the job store and ecce-results write save results. Identify how the scan, geometry-trace, and MD panels currently read parsed properties, and check the H₂ potential curve example (#858) for the data it needs. Done means /trace stores per-point coordinates and energy, with scan coordinate and optional gradient and cell, and those panels can read it; the issue marks this work as low priority.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Beschreibung

Today results.h5 holds one geometry's basis, MOs and density; a scan's energies and geometries per point (SCANCOORD, SCANENERGY, GEOMTRACE) and an optimisation or MD trace live only in ECCE's parsed properties, and the raw output has to be kept for re-parsing. Example: the H₂ potential curve (#858) is 26 MB of ORCA output for five scans, mostly the orbitals and gradient printed at every step.

Wanted: a /trace group in results.h5 (TREXIO-style naming as the rest of the file): per point the coordinates, energy, scan coordinate value, and optionally gradient and cell; written by the job store and ecce-results write, read by the scan, geometry-trace and MD panels. Then an example can ship results.h5 plus the small parsed properties instead of the full output.

Low priority (back burner).

Vorherrschende Sprache
C
Sterne
10
Forks
8
Ø Merge
21 Min.
Gemergte PRs (30 T.)
1

Entwicklungsumgebung

Dieses Projekt bietet weder Dev-Container noch Dockerfile noch Beitragsleitfaden – die Einrichtung liegt bei Ihnen. Beginnen Sie mit der README; die allgemeinen Schritte stehen in unserem Leitfaden für den ersten Beitrag.

Erste Schritte

  1. Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
  4. Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

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