Parent Issue: Functions for investigating networks
Ninguém assumiu esta issue ainda.
Avaliação
- Dificuldade
- 5/5
- Tempo estimado
- Mais de uma semana
- Facilidade para iniciantes
- 20/100
Direção de pesquisa
Start by reviewing issue 239 and the requested network-analysis scope: node neighbors, community detection, global properties, and topological overlap. The issue mentions weighted stochastic block models and igraph_community_leiden as possible directions, but leaves the algorithm and completion criteria undecided; clarify those before implementation.
Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.
Descrição
We should do this sooner than expected, because it's a dependency for the Microbiome Paper.
- https://github.com/VEuPathDB/plot.data/issues/239
- make a function to get a node's neighbors
- implement community detection algorithm. Consider (weighted) stochastic block model (ex) or possibly
igraph_community_leiden. tbd. - Some global property like core-periphery ness or small worldness (weighted version).
- Topological overlap
Should have some local (based around a node and its direct neighbors), some mesoscale, and a few global (though that's probably less important in this context).
- Linguagem predominante
- R
- Estrelas
- 1
- Forks
- 0
- Métricas de merge de PRs
- Nenhum PR com merge em 30d
Preparar o ambiente
Inicia o contêiner de desenvolvimento do projeto no navegador, com a sua própria conta do GitHub.
- Sem Dockerfile nem arquivo Docker Compose
- Sem modelo de pull request
- Sem guia de contribuição
Primeiros passos
- Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
- Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
- Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
- Abra um pull request que referencie o número da issue.
Mais de VEuPathDB/plot.data
-
Need to look into exports of `toJSON`Talvez já em andamento Um pull request vinculado a esta issue está aberto ou já foi mesclado. Aberta
Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 25/100
-
Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100
-
Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100
-
Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100
-
empty two by twoAberta
Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100
Todas as issues de VEuPathDB/plot.data
Issues semelhantes
-
Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 72/100
rstudio/reticulate#1933 ·
-
Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 62/100
-
Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 66/100
Mantenedores costumam responder em até 1 dia
-
Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 68/100
lrberge/fixest#686 · 2 comentários ·
Mantenedores costumam responder em até 1 dia
-
Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 82/100