Parent Issue: Functions for investigating networks
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 5/5
- Thời gian dự kiến
- Hơn một tuần
- Mức phù hợp với người mới
- 20/100
Hướng nghiên cứu
Start by reviewing issue 239 and the requested network-analysis scope: node neighbors, community detection, global properties, and topological overlap. The issue mentions weighted stochastic block models and igraph_community_leiden as possible directions, but leaves the algorithm and completion criteria undecided; clarify those before implementation.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
We should do this sooner than expected, because it's a dependency for the Microbiome Paper.
- https://github.com/VEuPathDB/plot.data/issues/239
- make a function to get a node's neighbors
- implement community detection algorithm. Consider (weighted) stochastic block model (ex) or possibly
igraph_community_leiden. tbd. - Some global property like core-periphery ness or small worldness (weighted version).
- Topological overlap
Should have some local (based around a node and its direct neighbors), some mesoscale, and a few global (though that's probably less important in this context).
- Ngôn ngữ chính
- R
- Star
- 1
- Fork
- 0
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Hướng dẫn đóng góp
Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của VEuPathDB/plot.data
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 25/100
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
-
empty two by two Đang mở
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
Tất cả issue của VEuPathDB/plot.data
Issue tương tự
-
bug triage_needed
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
pharmaverse/rtables#1123 · 1 bình luận ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
-
Incorrect coaches in games.csv Đang mở
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 85/100
-
Trying to reassign a reactiveVal to the name of an existing reactiveVal doesn't overwrite the latter Đang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100