Support for non-equal MCMC chain lengths
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評価
調査の方向性
まず、posterior パッケージが現在、同じ長さの MCMC chain をどのように保存しているか、また既存のユーティリティがそれらの draw をどのように利用しているかを確認する。提案されている 3 つのアプローチ—thinning、NA padding、ネイティブな不等長保存—を比較する。1 つのアプローチを選択し、その保存方法とユーティリティの動作を定義して初めて、作業は完了となる。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Background
Some MCMC samplers produce chains of unequal length (e.g., WALNUTS). Currently, the posterior package does not support this case. This issue outlines some initial ideas for how to handle it.
Proposed options
- Option 1: Thin chains to equal length Automatically thin longer chains to match the shortest chain length.
- Option 2: Equal-length storage with
NApadding Store chains in the existing equal-length format but pad shorter chains withNAvalues. New utility functions or arguments would be added to support working with padded draws. - Option 3: Native support for non-equal chain lengths Support natively stored chains of different length.
- 主要言語
- R
- スター
- 172
- フォーク
- 27
- 平均マージ
- 5日 12時間
- マージ済み PR（30日）
- 5
環境構築
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートあり
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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