Support for non-equal MCMC chain lengths

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Evaluación

Dificultad
5/5
Tiempo estimado
Más de una semana
Aptitud para principiantes
25/100
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Claridad
Necesita aclaración
Estado de actividad
Tranquilo
Stack tecnológico
r
Área
data

Línea de trabajo

Comienza revisando cómo el paquete posterior almacena actualmente cadenas MCMC de igual longitud y cómo las utilidades existentes consumen esas muestras. Compara los tres enfoques propuestos—thinning, NA padding y almacenamiento nativo de longitudes desiguales; el trabajo solo estará completo después de seleccionar un enfoque y definir el comportamiento de su almacenamiento y sus utilidades.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

Background

Some MCMC samplers produce chains of unequal length (e.g., WALNUTS). Currently, the posterior package does not support this case. This issue outlines some initial ideas for how to handle it.

Proposed options
  • Option 1: Thin chains to equal length Automatically thin longer chains to match the shortest chain length.
  • Option 2: Equal-length storage with NA padding Store chains in the existing equal-length format but pad shorter chains with NA values. New utility functions or arguments would be added to support working with padded draws.
  • Option 3: Native support for non-equal chain lengths Support natively stored chains of different length.
Lenguaje dominante
R
Estrellas
172
Forks
27
Merge medio
5 d 12 h
PR fusionados (30 d)
5

Preparar el entorno

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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