Support for non-equal MCMC chain lengths

Đang mở
#449 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
5/5
Thời gian dự kiến
Hơn một tuần
Mức phù hợp với người mới
25/100
Loại issue
Tính năng
Độ rõ ràng
Cần làm rõ
Mức độ hoạt động
Ít trao đổi
Công nghệ
r
Lĩnh vực
data

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu bằng cách xem xét cách package posterior hiện đang lưu trữ các chuỗi MCMC có cùng độ dài và cách các tiện ích hiện có sử dụng các mẫu đó. So sánh ba cách tiếp cận được đề xuất—thinning, NA padding và lưu trữ native với độ dài không bằng nhau; công việc chỉ hoàn tất sau khi một cách tiếp cận được chọn và hành vi lưu trữ cùng các tiện ích của nó được xác định.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

Background

Some MCMC samplers produce chains of unequal length (e.g., WALNUTS). Currently, the posterior package does not support this case. This issue outlines some initial ideas for how to handle it.

Proposed options
  • Option 1: Thin chains to equal length Automatically thin longer chains to match the shortest chain length.
  • Option 2: Equal-length storage with NA padding Store chains in the existing equal-length format but pad shorter chains with NA values. New utility functions or arguments would be added to support working with padded draws.
  • Option 3: Native support for non-equal chain lengths Support natively stored chains of different length.
Ngôn ngữ chính
R
Star
172
Fork
27
Merge trung bình
5 ngày 12 giờ
Pull request đã merge (30 ngày)
5

Chuẩn bị môi trường

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của stan-dev/posterior

Tất cả issue của stan-dev/posterior

Issue tương tự

Thêm issue về R

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.