Support for non-equal MCMC chain lengths
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 5/5
- Thời gian dự kiến
- Hơn một tuần
- Mức phù hợp với người mới
- 25/100
Hướng nghiên cứu
Bắt đầu bằng cách xem xét cách package posterior hiện đang lưu trữ các chuỗi MCMC có cùng độ dài và cách các tiện ích hiện có sử dụng các mẫu đó. So sánh ba cách tiếp cận được đề xuất—thinning, NA padding và lưu trữ native với độ dài không bằng nhau; công việc chỉ hoàn tất sau khi một cách tiếp cận được chọn và hành vi lưu trữ cùng các tiện ích của nó được xác định.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
Background
Some MCMC samplers produce chains of unequal length (e.g., WALNUTS). Currently, the posterior package does not support this case. This issue outlines some initial ideas for how to handle it.
Proposed options
- Option 1: Thin chains to equal length Automatically thin longer chains to match the shortest chain length.
- Option 2: Equal-length storage with
NApadding Store chains in the existing equal-length format but pad shorter chains withNAvalues. New utility functions or arguments would be added to support working with padded draws. - Option 3: Native support for non-equal chain lengths Support natively stored chains of different length.
- Ngôn ngữ chính
- R
- Star
- 172
- Fork
- 27
- Merge trung bình
- 5 ngày 12 giờ
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 5
Chuẩn bị môi trường
- Không có Dockerfile hay tệp Docker Compose
- Có mẫu pull request
- Đọc hướng dẫn đóng góp
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của stan-dev/posterior
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 62/100
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
-
Use testthat 3eCó thể đã có người làm @mcol đã nhận 6 ngày trước. Đang mởgood first issue test
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 65/100
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100
-
stop using r_eff in ps_tail_lengthCó thể đã có người làm @florence-bockting đã nhận 4 ngày trước. Đang mở
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 50/100
Tất cả issue của stan-dev/posterior
Issue tương tự
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 82/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
documentation priority: low
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100
Pascal-Kueng/dyadMLM#179 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Consider changesĐang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
OHDSI/OmopSketch#618 ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
GSK-Biostatistics/tfrmt#854 ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 62/100