Support for non-equal MCMC chain lengths
Nessuno ha ancora preso questa issue.
Valutazione
- Difficoltà
- 5/5
- Tempo stimato
- Più di una settimana
- Idoneità per principianti
- 25/100
Direzione di ricerca
Inizia esaminando come il package posterior memorizza attualmente catene MCMC di uguale lunghezza e come le utility esistenti utilizzano questi campioni. Confronta i tre approcci proposti—thinning, NA padding e memorizzazione nativa di lunghezze diverse; il lavoro sarà completo solo dopo aver selezionato un approccio e definito il comportamento della relativa memorizzazione e delle utility.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Background
Some MCMC samplers produce chains of unequal length (e.g., WALNUTS). Currently, the posterior package does not support this case. This issue outlines some initial ideas for how to handle it.
Proposed options
- Option 1: Thin chains to equal length Automatically thin longer chains to match the shortest chain length.
- Option 2: Equal-length storage with
NApadding Store chains in the existing equal-length format but pad shorter chains withNAvalues. New utility functions or arguments would be added to support working with padded draws. - Option 3: Native support for non-equal chain lengths Support natively stored chains of different length.
- Lingua principale
- R
- Stelle
- 172
- Fork
- 27
- Merge medio
- 5g 12h
- PR unite (30g)
- 5
Preparare l'ambiente
- Nessun Dockerfile né file Docker Compose
- Ha un modello di pull request
- Leggi la guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
Altre issue di stan-dev/posterior
-
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 62/100
-
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100
-
Use testthat 3eForse già presa @mcol l’ha presa 6 giorni fa. Apertagood first issue test
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 65/100
-
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100
-
stop using r_eff in ps_tail_lengthForse già presa @florence-bockting l’ha presa 4 giorni fa. Aperta
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 50/100
Tutte le issue di stan-dev/posterior
Issue simili
-
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 82/100
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
-
documentation priority: low
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 70/100
Pascal-Kueng/dyadMLM#179 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
-
Consider changesAperta
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 68/100
OHDSI/OmopSketch#618 ·
-
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 68/100
GSK-Biostatistics/tfrmt#854 ·
-
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 62/100