Extension to correlated observables
まだ誰も着手していません。
評価
- 難易度
- 5/5
- 見積もり時間
- 1週間以上
- 初心者へのやさしさ
- 25/100
- issue の種類
- 機能追加
- 明瞭さ
- 説明が足りない
- 活発さ
- 停滞
- 領域
- data
調査の方向性
No files or tests are identified in the issue. Start by reviewing the PEtab observable and noise-model specifications, then determine how correlation groups for phospho-peptide measurements should be represented. Done means the format is agreed and PEtab supports specifying and interpreting those relationships.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Which problem would you like to address? Please describe.
Mapping of phospho-peptides to protein phospho sites can be ambiguous, leading to correlations in the measured data. This could be captured in the noise model, but PEtab currently doesn't allow the specification of such relationships.
Describe the solution you would like
Extend the PEtab to allow the specification of correlation groups. Specific format would have to be discussed.
Describe alternatives you have considered
Alternative is probably summation of observables to avoid errors from unaccounted correlations.
- 主要言語
- 言語のデータがありません
- スター
- 67
- フォーク
- 16
- 平均マージ
- 1日 19時間
- マージ済み PR（30日）
- 1
環境構築
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートなし
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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