Hacktoberfest 2026：メンテナが10月に向けて印を付けた、オープンで初心者向けの issue。 Hacktoberfest の issue を見る

Roadmap: Planned Features & Milestones

オープン
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評価

難易度
5/5
見積もり時間
1週間以上
初心者へのやさしさ
8/100
issue の種類
機能追加
明瞭さ
説明が足りない
活発さ
停滞
技術スタック
github-actions, javascript, rust, wasm
領域
bioinformatics, data-visualization

調査の方向性

This is a roadmap checklist, not a task, and it names no files or entry points. Before starting, ask the maintainer which single unchecked item they want and open a separate issue for it. Only then read the parser code that item touches and the existing tests for it. Done means that item is implemented, tested, and checked off here.

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

説明

Core Infrastructure
using Async where possible, parsing bioinformatic file types

  • Genbank parser
  • Embl parser
  • Conversions of formats into gbk/embl/fasta/ffn/faa and save as gff/gbk or embl
  • CI/CD with github actions and write tests - ongoing
  • Documentation with examples - ongoing

Format expansion
Integration of common types and parsers such as:

  • VCF
  • BLAST output in various modes, -5 (XML) and -6 (one line per hit), compat with Diamond, MMSeqs2
  • GTF
  • link ups with formats from rust-bio, noodles-vcf
  • look into metabolomics options (like KEGG) some are not open-source
  • fastq gzipped version parsing
  • SAM format parser
  • RPKM output parser
  • Support for other compressed files such as BAM and CRAM
  • Writer support for those types

Advanced features
Protein parameters such as:

  • Hydrophobicity
  • Molecular weight
  • Counted amino acids & as percentage
  • Aromaticity
  • Parsing phylogenetic trees
  • Parsing multiple sequence alignments
  • Methylation data parsing
  • Consider pyo3 integration

Testing - bioinformatics

  • Testing & updating parsers with various edge case files such as gbk with the CONTIG(JOIN) structure

Data Viz

  • Example heatmap with WASM and Js example
  • Simple graph types bar, line, scatter
主要言語
Rust
スター
38
フォーク
15
平均マージ
21時間 33分
マージ済み PR（30日）
2

環境構築

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

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