Hacktoberfest 2026: die Issues, die Maintainer für den Oktober markiert haben – offen und einsteigerfreundlich. Hacktoberfest-Issues durchsuchen

Roadmap: Planned Features & Milestones

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Bewertung

Schwierigkeit
5/5
Geschätzter Aufwand
Über eine Woche
Anfängerfreundlichkeit
8/100
Issue-Typ
Feature
Klarheit
Muss geklärt werden
Aktivitätsstatus
Veraltet
Tech-Stack
github-actions, javascript, rust, wasm
Bereich
bioinformatics, data-visualization

Rechercherichtung

This is a roadmap checklist, not a task, and it names no files or entry points. Before starting, ask the maintainer which single unchecked item they want and open a separate issue for it. Only then read the parser code that item touches and the existing tests for it. Done means that item is implemented, tested, and checked off here.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Beschreibung

Core Infrastructure
using Async where possible, parsing bioinformatic file types

  • Genbank parser
  • Embl parser
  • Conversions of formats into gbk/embl/fasta/ffn/faa and save as gff/gbk or embl
  • CI/CD with github actions and write tests - ongoing
  • Documentation with examples - ongoing

Format expansion
Integration of common types and parsers such as:

  • VCF
  • BLAST output in various modes, -5 (XML) and -6 (one line per hit), compat with Diamond, MMSeqs2
  • GTF
  • link ups with formats from rust-bio, noodles-vcf
  • look into metabolomics options (like KEGG) some are not open-source
  • fastq gzipped version parsing
  • SAM format parser
  • RPKM output parser
  • Support for other compressed files such as BAM and CRAM
  • Writer support for those types

Advanced features
Protein parameters such as:

  • Hydrophobicity
  • Molecular weight
  • Counted amino acids & as percentage
  • Aromaticity
  • Parsing phylogenetic trees
  • Parsing multiple sequence alignments
  • Methylation data parsing
  • Consider pyo3 integration

Testing - bioinformatics

  • Testing & updating parsers with various edge case files such as gbk with the CONTIG(JOIN) structure

Data Viz

  • Example heatmap with WASM and Js example
  • Simple graph types bar, line, scatter
Vorherrschende Sprache
Rust
Sterne
38
Forks
15
Ø Merge
21 Std. 33 Min.
Gemergte PRs (30 T.)
2

Entwicklungsumgebung

Erste Schritte

  1. Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
  4. Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

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