Hacktoberfest 2026: los issues que los mantenedores marcaron para octubre, abiertos y aptos para principiantes. Explorar issues de Hacktoberfest

Roadmap: Planned Features & Milestones

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Evaluación

Dificultad
5/5
Tiempo estimado
Más de una semana
Aptitud para principiantes
8/100
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Claridad
Necesita aclaración
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
github-actions, javascript, rust, wasm
Área
bioinformatics, data-visualization

Línea de trabajo

This is a roadmap checklist, not a task, and it names no files or entry points. Before starting, ask the maintainer which single unchecked item they want and open a separate issue for it. Only then read the parser code that item touches and the existing tests for it. Done means that item is implemented, tested, and checked off here.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

Core Infrastructure
using Async where possible, parsing bioinformatic file types

  • Genbank parser
  • Embl parser
  • Conversions of formats into gbk/embl/fasta/ffn/faa and save as gff/gbk or embl
  • CI/CD with github actions and write tests - ongoing
  • Documentation with examples - ongoing

Format expansion
Integration of common types and parsers such as:

  • VCF
  • BLAST output in various modes, -5 (XML) and -6 (one line per hit), compat with Diamond, MMSeqs2
  • GTF
  • link ups with formats from rust-bio, noodles-vcf
  • look into metabolomics options (like KEGG) some are not open-source
  • fastq gzipped version parsing
  • SAM format parser
  • RPKM output parser
  • Support for other compressed files such as BAM and CRAM
  • Writer support for those types

Advanced features
Protein parameters such as:

  • Hydrophobicity
  • Molecular weight
  • Counted amino acids & as percentage
  • Aromaticity
  • Parsing phylogenetic trees
  • Parsing multiple sequence alignments
  • Methylation data parsing
  • Consider pyo3 integration

Testing - bioinformatics

  • Testing & updating parsers with various edge case files such as gbk with the CONTIG(JOIN) structure

Data Viz

  • Example heatmap with WASM and Js example
  • Simple graph types bar, line, scatter
Lenguaje dominante
Rust
Estrellas
38
Forks
15
Merge medio
21 h 33 min
PR fusionados (30 d)
2

Preparar el entorno

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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