Proposal to migrate `DelayedMask` to the DelayedArray package
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評価
- 難易度
- 5/5
- 見積もり時間
- 1週間以上
- 初心者へのやさしさ
- 20/100
- issue の種類
- 機能追加
- 明瞭さ
- 説明が足りない
- 活発さ
- 停滞
- 技術スタック
- r
- 領域
- data, performance
調査の方向性
まず alabaster.matrix の DelayedMask 実装と、DelayedArray における遅延 [<- 処理（DelayedNaryIsoOp と extract_*_array() の呼び出しを含む）を確認します。移行または汎用的なマスキングを DelayedArray に含めるべきかを判断し、提案する動作と効率上のトレードオフを文書化します。完了には、合意された実装範囲または maintainer の判断が必要です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
My alabaster.matrix package has a DelayedMask class that replaces all instances of a placeholder with an NA value during extract_*_array() calls. Essentially, it is equivalent to:
library(DelayedArray)
y <- DelayedArray(matrix(rbinom(100, 1, 0.2), ncol=5))
placeholder <- 1
z <- y
z[z == placeholder] <- NA
# Gives the same (abstract) matrix contents as:
alabaster.matrix::DelayedMask(y, placeholder)
AFAICT the DelayedMask approach should be more efficient as the DelayedMask only realizes one matrix while the delayed [<- requires realization of both z and z == placeholder. (Currently DelayedMask is literally for masking NAs but it could be generalized to handle more boolean operations, e.g., so z[z > cap] <- cap could be used to upper-bound the contents of the matrix.)
Would this be of interest to the DelayedArray package? Perhaps there might be an easy way that we can detect that the logical subset is generated from the same matrix that it is operating on in [<-, and switch from creating a DelayedNaryIsoOp to a DelayedMask.
- 主要言語
- R
- スター
- 29
- フォーク
- 12
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
コントリビューションガイド
このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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