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Conversion to dgCMatrix Causes Segmentation Fault

オープン
#129 コメント 5 件 リアクション 0 件 担当者 0 名 GitHub で見る

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評価

難易度
4/5
見積もり時間
3〜5日
初心者へのやさしさ
38/100
issue の種類
バグ
明瞭さ
説明が足りない
活発さ
活発
技術スタック
r
領域
data

調査の方向性

ソースファイルもテストも指定されていません。まず、報告された次元を使って DelayedMatrix から dgCMatrix への変換を再現し、次に変換のエントリーポイントを追跡して、関連する R とパッケージのバージョンを記録してください。このケースで変換が segfault を起こさなくなり、回帰テストでカバーされれば完了です。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

説明

dim(database)
    109578 2389155
class(counts(database))
    "DelayedMatrix"

After about four hours.

assay(database, "counts") <- as(assay(database, "counts"), "dgCMatrix")
     *** caught segfault ***
    address 0x7fc394337000, cause 'invalid permissions'
主要言語
R
スター
29
フォーク
12
PR マージ指標
30日以内にマージされた PR はありません

コントリビューションガイド

このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

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