GROMACS editor after a run: internal file names, stale status, developer text
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Valutazione
- Difficoltà
- 2/5
- Tempo stimato
- 1-3 ore
- Idoneità per principianti
- 70/100
Direzione di ricerca
Inizia da ResourceUtils.C, dove viene costruito il nome del file del content-type ecceSession_ecceMdOptimize.gro, e da GromacsInputsPanel::refresh, dove viene impostata la riga di stato. Verifica come l'editor mostra il nome del file allegato e il nome della topologia, e dove si trova il testo del paragrafo introduttivo. È completato quando la scheda Inputs mostra em.gro e processed.top come allegati, lo stato dopo l'esecuzione indica che gli input restano fissi fino a Reset, e l'introduzione conserva solo le prime due frasi.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Seen 2026-10-15 in the GROMACS MD Optimize editor after a finished minimisation (Inputs tab, read only).
- Starting structure shows ecceSession_ecceMdOptimize.gro, a name built from the content type (ResourceUtils.C), instead of the attached file's name (em.gro). The editor should keep showing the name the user attached.
- Status line still reads "Ready: a topology and a starting structure are attached." (GromacsInputsPanel::refresh). After a run it should say the calculation has run and its inputs are fixed until Reset.
- Topology shows processed.gmxtop, the internal storage name; show processed.top, as attached.
- The intro paragraph includes developer detail ("A topology is kept as .gmxtop so it cannot be mistaken for an NWChem topology; the job still sees it as topol.top."). Keep the first two sentences.
For the GROMACS round, with #334.
- Lingua principale
- C
- Stelle
- 10
- Fork
- 8
- Merge medio
- 21m
- PR unite (30g)
- 1
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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