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Custom delayed operations

Aberta
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Avaliação

Dificuldade
4/5
Tempo estimado
3-5 dias
Facilidade para iniciantes
45/100
Tipo de issue
Funcionalidade
Clareza
Razoavelmente clara
Status de atividade
Pouca atividade
Stack de tecnologia
r
Domínio
data

Direção de pesquisa

Comece lendo os métodos showtree e .rec_showtree e, em seguida, rastreie como getArrayElement trata subclasses de DelayedOp. Reproduza o exemplo com DelayedAffineSeed e DelayedTranslateSeed, incluindo a operação de subconjunto no array Zarr temporário. O trabalho estará concluído quando classes externas que contêm DelayedOp puderem participar do fluxo solicitado de inspeção ou acesso a operações adiadas sem o erro reportado de método ausente.

Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.

Descrição

Dear @hpages,

I am working on devising lazy image transformations for https://github.com/HelenaLC/SpatialData/issues/162.

I was wondering if it is possible to use showtree or .rec_showtree methods (or similar methods) for external classes that facilitate delayed operations.

I have tried below, but it requires me to define additional methods for these classes that contain DelayedOp:

setClass(
  "DelayedAffineSeed",
  contains = "DelayedOp",
  slots = c(
    seed = "ANY",
    dim = "integer",
    dimnames = "list",
    m = "matrix",
    axes = "character",
    filter = "character",
    bg.col = "character",
    antialias = "logical",
    trace = "logical"
  )
)

setClass(
  "DelayedTranslateSeed",
  contains = "DelayedOp",
  slots = c(
    seed = "ANY",
    dim = "integer",
    dimnames = "list",
    shift = "numeric",
    axes = "character"
  )
)

# save as zarr
td <- tempfile(fileext = ".zarr")
delayed_img <- writeZarrArray(x = EBImage::imageData(img), zarr_path = td) 

# affine
rotated_delayed_img <- lazy_affine(delayed_img, m = m, filter = "bilinear")

# translate
translate_delayed_img <- lazy_translate(rotated_delayed_img, shift = c(100,200))

# subset
subset_delayed_img <- translate_delayed_img[100:200, 100:200]

> subset_delayed_img@seed
101x101 double: Subset
└─ 1024x512 double: DelayedTranslateSeed object
Error: unable to find an inherited method for function ‘getArrayElement’ for signature ‘x = "DelayedTranslateSeed"’
Linguagem predominante
R
Estrelas
29
Forks
12
Nenhum PR com merge em 30d

Guia de contribuição

Nenhum guia de contribuição indexado para este repositório

Primeiros passos

  1. Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
  2. Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
  3. Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
  4. Abra um pull request que referencie o número da issue.

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