sunlabuiuc

Les issues sur lesquelles quelqu’un travaille peut-être déjà sont listées en dernier. Tout trier par date

• clean_path() normalises URL paths with os.path.normpath, breaking every URL-rooted dataset on Windows

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  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 77/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1333 · Ouverte le 26/10/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Add Survival Mixture Density Networks for survival prediction

  Ouverte

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  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 30/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1297 · Ouverte le 15/10/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Interrupted first build leaves a partial event table which later runs use without a warning

  Ouverte

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  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 22/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1295 · Ouverte le 14/10/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• OMOP: add observation_period and visit_detail to the default config

  Ouverte

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  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 42/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1294 · 1 commentaire · Ouverte le 14/10/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• FHIR Bug Issues Thread

  Ouverte

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  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 48/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1157 · 1 commentaire · Ouverte le 7/6/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Generative modeling module bug forum thread

  Ouverte

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  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1156 · 1 commentaire · Ouverte le 7/6/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Reproducibility gap in ICU pathogen prediction benchmarks (MIMIC-IV)

  Ouverte

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  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1153 · 1 commentaire · Ouverte le 29/5/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• [Feature] Implement KeyClass (Weak Supervision) for Clinical Notes

  Ouverte

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  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1107 · Ouverte le 22/4/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Interpretability Target_Idx / Multilabel setting is not well-defined

  Ouverte

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  documentation

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 38/100

  sunlabuiuc/PyHealth#915 · 1 commentaire · Ouverte le 27/3/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• PyHealth trainer uses deprecated model.mode attribute instead of checking its output or label processors

  Peut-être à nouveau libre Une pull request pour cette issue a été fermée sans être fusionnée. Ouverte

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  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 38/100

  sunlabuiuc/PyHealth#914 · 1 commentaire · Ouverte le 27/3/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Add SepsisPredictionEICU and SepsisPredictionMIMIC4 tasks — pre-ICU window, Sepsis-3 proxy labeling

  Peut-être à nouveau libre @zhaog100 l’a pris il y a 215 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#911 · 3 commentaires · Ouverte le 25/3/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Add documentation to each dataset on download sources, and what files specifically are compatible.

  Peut-être à nouveau libre @sevvaluluss l’a pris il y a 208 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#883 · 3 commentaires · Ouverte le 6/3/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• PyHealth processors -> embeddings not clear which are compatible

  Ouverte

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  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

  sunlabuiuc/PyHealth#865 · Ouverte le 20/2/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• A few interpreters (e.g. SHAP & LIME, maybe more) incorrectly always assume input is sequence or time series

  Peut-être à nouveau libre @sakshigupta1528 l’a pris il y a 7 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 48/100

  sunlabuiuc/PyHealth#858 · 3 commentaires · Ouverte le 17/2/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Investigate whether short circuit if statements speed up task sample processing

  Peut-être à nouveau libre @yugdave0911 l’a pris il y a 196 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 38/100

  sunlabuiuc/PyHealth#843 · 4 commentaires · Ouverte le 12/2/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Dataset cache name doesn't seem to include the tables used when cache_dir is set.

  Ouverte

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  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100

  sunlabuiuc/PyHealth#833 · Ouverte le 9/2/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• masking has been proven to be problematic even for now. especially some methods will zero values for perturbation, which cause the x.sum(dim=...) == 0 method fail significantly.

  Ouverte

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  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 30/100

  sunlabuiuc/PyHealth#820 · Ouverte le 5/2/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Interpretability bugs and improvements required

  Ouverte

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  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 28/100

  sunlabuiuc/PyHealth#817 · Ouverte le 5/2/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Add a `.clear_cache` and `.clear_task_cache` method to avoid the need to manually delete the cache.

  Peut-être à nouveau libre @Eshaan-byte l’a pris il y a 297 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  sunlabuiuc/PyHealth#765 · 2 commentaires · 1 personne assignée · Ouverte le 1/1/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Better docs for the cache behaviour.

  Peut-être à nouveau libre @JairoTM-es l’a pris il y a 297 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  sunlabuiuc/PyHealth#763 · 9 commentaires · 1 personne assignée · Ouverte le 1/1/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• [Tracking] Tracking issue for the new memory efficient dataset.

  Peut-être à nouveau libre @Logiquo l’a pris il y a 312 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  sunlabuiuc/PyHealth#740 · 3 commentaires · 1 personne assignée · Ouverte le 17/12/2025

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Integrate senselab for speech analysis in health

  Peut-être à nouveau libre @Chelsy-AI l’a pris il y a 140 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  enhancement

  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100

  sunlabuiuc/PyHealth#566 · 3 commentaires · Ouverte le 26/9/2025

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• parser for table NOTEEVENTS is not implemented yet.

  Peut-être à nouveau libre Une pull request pour cette issue a été fermée sans être fusionnée. Ouverte

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  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 30/100

  sunlabuiuc/PyHealth#512 · 1 commentaire · Ouverte le 13/5/2025

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Update model API to better fit new dataloading framework.

  Ouverte

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  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#426 · Ouverte le 6/5/2025

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Unit Tests

  Peut-être à nouveau libre Une pull request pour cette issue a été fermée sans être fusionnée. Ouverte

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  help wanted

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

  sunlabuiuc/PyHealth#425 · Ouverte le 6/5/2025

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Fix the datetime in synthetic mimic-iii data

  Ouverte

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  bug

  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 45/100

  sunlabuiuc/PyHealth#373 · 1 commentaire · Ouverte le 1/5/2025

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Fix sample dataset indexing

  Peut-être à nouveau libre @ram-from-tvl l’a pris il y a 390 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  sunlabuiuc/PyHealth#369 · 2 commentaires · 1 personne assignée · Ouverte le 30/4/2025

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• EEG Datasets Need to Conform with 2.0 Backend

  Ouverte

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  core

  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100

  sunlabuiuc/PyHealth#340 · Ouverte le 18/4/2025

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Improve unittests and Github actions

  Peut-être à nouveau libre Une pull request pour cette issue a été fermée sans être fusionnée. Ouverte

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  infra

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

  sunlabuiuc/PyHealth#338 · Ouverte le 16/4/2025

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Integration with MEDS

  Ouverte

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  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#329 · Ouverte le 9/4/2025

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Expand MIMIC-III configs

  Peut-être à nouveau libre @jhnwu3 l’a pris il y a 565 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  enhancement

  sunlabuiuc/PyHealth#328 · 1 personne assignée · Ouverte le 9/4/2025

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Expand MIMIC-IV configs

  Peut-être à nouveau libre @jhnwu3 l’a pris il y a 565 jours, et aucune pull request n’est ouverte. Ouverte

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  enhancement

  sunlabuiuc/PyHealth#327 · 1 commentaire · 1 personne assignée · Ouverte le 9/4/2025

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Update signal API

  Ouverte

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  core

  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#325 · Ouverte le 9/4/2025

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Update document to reflect the changes in v2.0

  Ouverte

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  documentation

  Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 38/100

  sunlabuiuc/PyHealth#324 · 3 commentaires · Ouverte le 9/4/2025

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• HALO and EHR synthetic task

  Ouverte

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  sunlabuiuc/PyHealth#279 · 2 commentaires · Ouverte le 15/4/2024

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Bug: SHHS sleep staging can raise IndexError when signal epochs exceed available labels Copy title

  Peut-être pris @cpruijsen l’a pris il y a 17 jours. Ouverte

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  sunlabuiuc/PyHealth#1283 · Ouverte le 9/10/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Internal transfers are counted as readmissions

  Peut-être pris @thebean27 l’a pris il y a 20 jours. Ouverte

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  sunlabuiuc/PyHealth#1269 · 3 commentaires · Ouverte le 5/10/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Feature request: logistic recalibration (intercept and slope updating)

  Peut-être pris @yfeng3212 l’a pris il y a 21 jours. Ouverte

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  sunlabuiuc/PyHealth#1250 · Ouverte le 30/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• multiclass_metrics_fn "hits@n" does not allow specifying n and returns hard-coded HITS@1/5/10

  Peut-être pris @Karnis052 l’a pris il y a 15 jours. Ouverte

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  sunlabuiuc/PyHealth#1248 · 2 commentaires · Ouverte le 28/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• multilabel_metrics_fn crashes when a thresholded metric comes after "ddi" in the metrics list

  Peut-être pris @Om-singhaI l’a pris il y a 35 jours. Ouverte

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  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1242 · Ouverte le 22/9/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• PyHealth 2.0: several modules still target the 1.x dataset API

  Peut-être pris Une pull request liée à cette issue est ouverte ou déjà fusionnée. Ouverte

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  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1201 · 3 commentaires · Ouverte le 25/8/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Refactor: split CheferInterpretable into AttentionInterpretable and GradientInterpretable

  Peut-être pris @LIU-kaiyu l’a pris il y a 50 jours. Ouverte

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  enhancement refactor

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1166 · Ouverte le 21/6/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• fix: add missing stacklevel=2 to warnings.warn() calls

  Peut-être pris @rtmalikian l’a pris il y a 128 jours. Ouverte

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  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 20/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1164 · Ouverte le 20/6/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• fix: kg_emb broken import in PyHealth 2.0

  Peut-être pris @userjuma l’a pris il y a 68 jours. Ouverte

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  Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 35/100

  sunlabuiuc/PyHealth#952 · 3 commentaires · Ouverte le 7/4/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Task hash should probably also include the init args of a TaskClass()

  Peut-être pris @7arnav1 l’a pris il y a 96 jours. Ouverte

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  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 52/100

  sunlabuiuc/PyHealth#916 · 2 commentaires · Ouverte le 27/3/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Create file structure standard/documentation for how people should port over their task data splits.

  Peut-être pris @Aprameyaraya l’a pris il y a 13 jours. Ouverte

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  Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

  sunlabuiuc/PyHealth#913 · Ouverte le 27/3/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• trainer.evaluate of metrics is inconsistent due to batch-wise aggregation

  Peut-être pris @azrabano23 l’a pris il y a 63 jours. Ouverte

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  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 20/100

  sunlabuiuc/PyHealth#859 · 4 commentaires · Ouverte le 17/2/2026

  Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours

• Add normalization support in `pyhealth/processors/timeseries_processor.py`

  Peut-être pris @LIU-kaiyu l’a pris il y a 50 jours. Ouverte

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  enhancement

  Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#491 · Ouverte le 8/5/2025

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