sunlabuiuc

可能已有人在做的 issue 排在最后。 全部按时间排序

• clean_path() normalises URL paths with os.path.normpath, breaking every URL-rooted dataset on Windows

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  难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 77/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1333 · 2026年10月26日 创建

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• Add Survival Mixture Density Networks for survival prediction

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  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 30/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1297 · 2026年10月15日 创建

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• Interrupted first build leaves a partial event table which later runs use without a warning

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  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 22/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1295 · 2026年10月14日 创建

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• OMOP: add observation_period and visit_detail to the default config

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  难度 3/5 1-2 天 新手友好度 42/100

  sunlabuiuc/PyHealth#1294 · 1 条评论 · 2026年10月14日 创建

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• FHIR Bug Issues Thread

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  sunlabuiuc/PyHealth#1157 · 1 条评论 · 2026年6月7日 创建

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• Generative modeling module bug forum thread

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  sunlabuiuc/PyHealth#1156 · 1 条评论 · 2026年6月7日 创建

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• Reproducibility gap in ICU pathogen prediction benchmarks (MIMIC-IV)

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  sunlabuiuc/PyHealth#1153 · 1 条评论 · 2026年5月29日 创建

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• [Feature] Implement KeyClass (Weak Supervision) for Clinical Notes

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  sunlabuiuc/PyHealth#1107 · 2026年4月22日 创建

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• Interpretability Target_Idx / Multilabel setting is not well-defined

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  documentation

  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 38/100

  sunlabuiuc/PyHealth#915 · 1 条评论 · 2026年3月27日 创建

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• PyHealth trainer uses deprecated model.mode attribute instead of checking its output or label processors

  可能重新可做 关联的 PR 已关闭且未合并。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#914 · 1 条评论 · 2026年3月27日 创建

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• Add SepsisPredictionEICU and SepsisPredictionMIMIC4 tasks — pre-ICU window, Sepsis-3 proxy labeling

  可能重新可做 @zhaog100 于 215 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#911 · 3 条评论 · 2026年3月25日 创建

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• Add documentation to each dataset on download sources, and what files specifically are compatible.

  可能重新可做 @sevvaluluss 于 208 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#883 · 3 条评论 · 2026年3月6日 创建

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• PyHealth processors -> embeddings not clear which are compatible

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  sunlabuiuc/PyHealth#865 · 2026年2月20日 创建

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• A few interpreters (e.g. SHAP & LIME, maybe more) incorrectly always assume input is sequence or time series

  可能重新可做 @sakshigupta1528 于 7 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#858 · 3 条评论 · 2026年2月17日 创建

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• Investigate whether short circuit if statements speed up task sample processing

  可能重新可做 @yugdave0911 于 196 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭

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  good first issue

  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 38/100

  sunlabuiuc/PyHealth#843 · 4 条评论 · 2026年2月12日 创建

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• Dataset cache name doesn't seem to include the tables used when cache_dir is set.

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  bug

  难度 3/5 1-2 天 新手友好度 45/100

  sunlabuiuc/PyHealth#833 · 2026年2月9日 创建

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• masking has been proven to be problematic even for now. especially some methods will zero values for perturbation, which cause the x.sum(dim=...) == 0 method fail significantly.

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  sunlabuiuc/PyHealth#820 · 2026年2月5日 创建

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• Interpretability bugs and improvements required

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  sunlabuiuc/PyHealth#817 · 2026年2月5日 创建

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• Add a `.clear_cache` and `.clear_task_cache` method to avoid the need to manually delete the cache.

  可能重新可做 @Eshaan-byte 于 298 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#765 · 2 条评论 · 已指派 1 人 · 2026年1月1日 创建

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• Better docs for the cache behaviour.

  可能重新可做 @JairoTM-es 于 298 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭

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  good first issue

  sunlabuiuc/PyHealth#763 · 9 条评论 · 已指派 1 人 · 2026年1月1日 创建

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• [Tracking] Tracking issue for the new memory efficient dataset.

  可能重新可做 @Logiquo 于 312 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#740 · 3 条评论 · 已指派 1 人 · 2025年12月17日 创建

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• Integrate senselab for speech analysis in health

  可能重新可做 @Chelsy-AI 于 140 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭

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  enhancement

  难度 5/5 一周以上 新手友好度 20/100

  sunlabuiuc/PyHealth#566 · 3 条评论 · 2025年9月26日 创建

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• parser for table NOTEEVENTS is not implemented yet.

  可能重新可做 关联的 PR 已关闭且未合并。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#512 · 1 条评论 · 2025年5月13日 创建

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• Update model API to better fit new dataloading framework.

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  bug

  难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#426 · 2025年5月6日 创建

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• Unit Tests

  可能重新可做 关联的 PR 已关闭且未合并。 未关闭

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  help wanted

  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100

  sunlabuiuc/PyHealth#425 · 2025年5月6日 创建

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• Fix the datetime in synthetic mimic-iii data

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  bug

  难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 45/100

  sunlabuiuc/PyHealth#373 · 1 条评论 · 2025年5月1日 创建

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• Fix sample dataset indexing

  可能重新可做 @ram-from-tvl 于 390 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭

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  bug

  sunlabuiuc/PyHealth#369 · 2 条评论 · 已指派 1 人 · 2025年4月30日 创建

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• EEG Datasets Need to Conform with 2.0 Backend

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  core

  难度 5/5 一周以上 新手友好度 20/100

  sunlabuiuc/PyHealth#340 · 2025年4月18日 创建

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• Improve unittests and Github actions

  可能重新可做 关联的 PR 已关闭且未合并。 未关闭

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  infra

  难度 3/5 1-2 天 新手友好度 35/100

  sunlabuiuc/PyHealth#338 · 2025年4月16日 创建

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• Integration with MEDS

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  infra question

  难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#329 · 2025年4月9日 创建

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• Expand MIMIC-III configs

  可能重新可做 @jhnwu3 于 565 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭

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  enhancement

  sunlabuiuc/PyHealth#328 · 已指派 1 人 · 2025年4月9日 创建

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• Expand MIMIC-IV configs

  可能重新可做 @jhnwu3 于 565 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭

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  enhancement

  sunlabuiuc/PyHealth#327 · 1 条评论 · 已指派 1 人 · 2025年4月9日 创建

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• Update signal API

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  core

  难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#325 · 2025年4月9日 创建

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• Update document to reflect the changes in v2.0

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  documentation

  难度 3/5 1-2 天 新手友好度 38/100

  sunlabuiuc/PyHealth#324 · 3 条评论 · 2025年4月9日 创建

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• HALO and EHR synthetic task

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  sunlabuiuc/PyHealth#279 · 2 条评论 · 2024年4月15日 创建

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• Bug: SHHS sleep staging can raise IndexError when signal epochs exceed available labels Copy title

  可能已有人在做 @cpruijsen 于 17 天前认领。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#1283 · 2026年10月9日 创建

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• Internal transfers are counted as readmissions

  可能已有人在做 @thebean27 于 20 天前认领。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#1269 · 3 条评论 · 2026年10月5日 创建

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• Feature request: logistic recalibration (intercept and slope updating)

  可能已有人在做 @yfeng3212 于 21 天前认领。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#1250 · 2026年9月30日 创建

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• multiclass_metrics_fn "hits@n" does not allow specifying n and returns hard-coded HITS@1/5/10

  可能已有人在做 @Karnis052 于 15 天前认领。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#1248 · 2 条评论 · 2026年9月28日 创建

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• multilabel_metrics_fn crashes when a thresholded metric comes after "ddi" in the metrics list

  可能已有人在做 @Om-singhaI 于 35 天前认领。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#1242 · 2026年9月22日 创建

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• PyHealth 2.0: several modules still target the 1.x dataset API

  可能已有人在做 关联的 PR 仍在进行中或已合并。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#1201 · 3 条评论 · 2026年8月25日 创建

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• Refactor: split CheferInterpretable into AttentionInterpretable and GradientInterpretable

  可能已有人在做 @LIU-kaiyu 于 50 天前认领。 未关闭

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  enhancement refactor

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  sunlabuiuc/PyHealth#1166 · 2026年6月21日 创建

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• fix: add missing stacklevel=2 to warnings.warn() calls

  可能已有人在做 @rtmalikian 于 128 天前认领。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#1164 · 2026年6月20日 创建

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• fix: kg_emb broken import in PyHealth 2.0

  可能已有人在做 @userjuma 于 68 天前认领。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#952 · 3 条评论 · 2026年4月7日 创建

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• Task hash should probably also include the init args of a TaskClass()

  可能已有人在做 @7arnav1 于 96 天前认领。 未关闭

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  documentation

  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 52/100

  sunlabuiuc/PyHealth#916 · 2 条评论 · 2026年3月27日 创建

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• Create file structure standard/documentation for how people should port over their task data splits.

  可能已有人在做 @Aprameyaraya 于 13 天前认领。 未关闭

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  sunlabuiuc/PyHealth#913 · 2026年3月27日 创建

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• trainer.evaluate of metrics is inconsistent due to batch-wise aggregation

  可能已有人在做 @azrabano23 于 64 天前认领。 未关闭

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  bug

  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 20/100

  sunlabuiuc/PyHealth#859 · 4 条评论 · 2026年2月17日 创建

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• Add normalization support in `pyhealth/processors/timeseries_processor.py`

  可能已有人在做 @LIU-kaiyu 于 50 天前认领。 未关闭

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  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 25/100

  sunlabuiuc/PyHealth#491 · 2025年5月8日 创建

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