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Conversion to dgCMatrix Causes Segmentation Fault

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Evaluación

Dificultad
4/5
Tiempo estimado
3-5 días
Aptitud para principiantes
38/100
Tipo de issue
Error
Claridad
Necesita aclaración
Estado de actividad
Activo
Stack tecnológico
r
Área
data

Línea de trabajo

No se especifica ningún archivo fuente ni ninguna prueba. Empieza reproduciendo la conversión de DelayedMatrix a dgCMatrix usando las dimensiones indicadas; después, sigue el punto de entrada de la conversión y registra las versiones relevantes de R y del paquete. Se considera terminado cuando la conversión ya no provoca un segfault en este caso y una prueba de regresión lo cubre.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

dim(database)
    109578 2389155
class(counts(database))
    "DelayedMatrix"

After about four hours.

assay(database, "counts") <- as(assay(database, "counts"), "dgCMatrix")
     *** caught segfault ***
    address 0x7fc394337000, cause 'invalid permissions'
Lenguaje dominante
R
Estrellas
29
Forks
12
Sin PR fusionados en 30 d

Guía de contribución

No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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