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Can't `cbind` DelayedArray instances with other matrix-likes

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Évaluation

Difficulté
3/5
Temps estimé
1-2 jours
Accessibilité débutants
65/100
Type d'issue
Bug
Clarté
Plutôt claire
Activité
Active
Stack technique
r
Domaine
data

Piste de recherche

Commencez par reproduire les exemples mixtes cbind(y, x) et cbind(y, y) de l’issue, puis examinez la résolution de méthode bindCOLS pour DelayedMatrix. Le travail est terminé lorsque cbind accepte un DelayedArray avec une matrice classique sans l’erreur de méthode signalée, tout en préservant le comportement de résultat existant de DelayedArray.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Description

I could have sworn this used to work.

library(DelayedArray)
x <- matrix(runif(100), 10, 10)
y <- DelayedArray(x)
cbind(y, x)
## Error in (function (classes, fdef, mtable)  : 
##   unable to find an inherited method for function ‘bindCOLS’ for signature ‘"DelayedMatrix"’

Two DelayedArrays are fine:

cbind(y, y)
## <10 x 20> matrix of class DelayedMatrix and type "double":
## etc.
Session information 
> sessionInfo()
R version 4.2.0 Patched (2022-05-06 r82323)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 18.04.6 LTS

Matrix products: default
BLAS:   /home/luna/Software/R/R-4-2-branch/lib/libRblas.so
LAPACK: /home/luna/Software/R/R-4-2-branch/lib/libRlapack.so

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats4    stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods  
[8] base     

other attached packages:
[1] DelayedArray_0.22.0  IRanges_2.30.0       S4Vectors_0.34.0    
[4] MatrixGenerics_1.8.0 matrixStats_0.62.0   BiocGenerics_0.42.0 
[7] Matrix_1.4-1        

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_4.2.0  grid_4.2.0      lattice_0.20-45
Langage dominant
R
Étoiles
29
Forks
12
Aucune PR mergée en 30 j

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