Can't `cbind` DelayedArray instances with other matrix-likes
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评估
调研方向
首先重现 issue 中混合使用的 cbind(y, x) 和 cbind(y, y) 示例,然后检查针对 DelayedMatrix 的 bindCOLS 方法分派。完成标准是 cbind 能够接受 DelayedArray 与普通矩阵一起使用而不再出现报告的方法错误,同时保留现有的 DelayedArray 结果行为。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
I could have sworn this used to work.
library(DelayedArray)
x <- matrix(runif(100), 10, 10)
y <- DelayedArray(x)
cbind(y, x)
## Error in (function (classes, fdef, mtable) :
## unable to find an inherited method for function ‘bindCOLS’ for signature ‘"DelayedMatrix"’
Two DelayedArrays are fine:
cbind(y, y)
## <10 x 20> matrix of class DelayedMatrix and type "double":
## etc.
Session information
> sessionInfo()
R version 4.2.0 Patched (2022-05-06 r82323)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 18.04.6 LTS
Matrix products: default
BLAS: /home/luna/Software/R/R-4-2-branch/lib/libRblas.so
LAPACK: /home/luna/Software/R/R-4-2-branch/lib/libRlapack.so
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
[7] LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats4 stats graphics grDevices utils datasets methods
[8] base
other attached packages:
[1] DelayedArray_0.22.0 IRanges_2.30.0 S4Vectors_0.34.0
[4] MatrixGenerics_1.8.0 matrixStats_0.62.0 BiocGenerics_0.42.0
[7] Matrix_1.4-1
loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_4.2.0 grid_4.2.0 lattice_0.20-45
- 主要语言
- R
- 星标
- 29
- 派生
- 12
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
贡献指南
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