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rdkit

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rdkit
The official sources for the RDKit library

HTML · 3591 estrellas
mmpdb
A package to identify matched molecular pairs and use them to predict property changes.

Python · 301 estrellas
rdkit-js
A powerful cheminformatics and molecule rendering toolbelt for JavaScript, powered by RDKit .

SCSS · 248 estrellas
UGM_2026
Repository for the 2026 RDKit UGM

19 estrellas

Para principiantes Todo

Abierto Todos

MOL2: UNITY_ATOM_ATTR section prevents correct formal charge assignment Abierto

bug

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 70/100

rdkit/rdkit#9634 · Abierto el 23/9/2026
CalcNumAtomStereoCenters() changes after identity RenumberAtoms() on bicyclic amines Abierto

bug

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 65/100

rdkit/rdkit#9629 · Abierto el 19/9/2026
Clarify mol_from_smiles vs qmol_from_smarts for substruct_count queries in Postgresql cartridge Abierto

enhancement

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 86/100

rdkit/rdkit#9624 · Abierto el 18/9/2026
Add mol_numatoms/mol_numheavyatoms support for qmol in Postgresql cartridge Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 50/100

rdkit/rdkit#9623 · Abierto el 18/9/2026
Improve depiction of RNA Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

rdkit/rdkit#9617 · Abierto el 18/9/2026
Depiction code doesn't recognize AtomAtomicNum as a list query Abierto

bug

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 72/100

rdkit/rdkit#9607 · Abierto el 17/9/2026
MolsFromChemDrawBlock needs a version with explicit AUTO/CDX/CDXML support Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

rdkit/rdkit#9604 · Abierto el 16/9/2026
Tracking: nanobind wrapper improvements Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

rdkit/rdkit#9601 · Abierto el 16/9/2026
MolToInchi adds spurious /b stereo for symmetric ylidene with 2D coordinates Abierto

bug

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100

rdkit/rdkit#9586 · Abierto el 15/9/2026
rdkit reports "Explicit valence for atom # 0 S, 7, is greater than permitted" for six-valent sulfur? Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 55/100

rdkit/rdkit#9581 · 6 comentarios · Abierto el 11/9/2026
Conflicting prototypes for function distdriver() Abierto

bug

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 72/100

rdkit/rdkit#9575 · 3 comentarios · Abierto el 9/9/2026
Add context managers to handle config options in python tests Abierto

enhancement

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 30/100

rdkit/rdkit#9559 · Abierto el 2/9/2026
Enable Link-Time-Optimization for production builds Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100

rdkit/rdkit#9554 · 3 comentarios · Abierto el 31/8/2026
Build Fails on AMD system Abierto

bug

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 57/100

rdkit/rdkit#9548 · 1 comentario · Abierto el 30/8/2026
Shipped rdkit-stubs .pyi files are not valid Python, which stops mypy before it checks any user code Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

rdkit/rdkit#9540 · 1 comentario · Abierto el 29/8/2026
Ubsan reports Division by zero in some tests Abierto

bug

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 68/100

rdkit/rdkit#9530 · 1 comentario · Abierto el 25/8/2026
Bug in sascorer due to discontinuity in smoothing function Abierto

bug

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 68/100

rdkit/rdkit#9524 · 7 comentarios · Abierto el 21/8/2026
Incremental Smiles Parsing + Sanitization improvements Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

rdkit/rdkit#9475 · 1 comentario · 1 reacción · Abierto el 9/8/2026
Unexpected behavior of ResonanceMolSupplier Abierto

bug

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 52/100

rdkit/rdkit#9458 · Abierto el 5/8/2026
Link to Visitor Registration Abierto

Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 92/100

rdkit/UGM_2026#3 · Abierto el 25/7/2026
Enantiomeric flipping in spiro compound with chiral ammonium Abierto

bug

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

rdkit/rdkit#9391 · 4 comentarios · 1 reacción · Abierto el 10/7/2026
CDXML reading doesn't use "bold" or "undirectional" hash bonds for stereochemistry Abierto

bug

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100

rdkit/rdkit#9359 · 3 comentarios · Abierto el 15/6/2026
FindPotentialStereo missing from Java Wrappers Abierto

enhancement stale

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 65/100

rdkit/rdkit#9350 · 2 comentarios · Abierto el 11/6/2026
Constraints for bond lenghts, angles and torsion during bounds matrix construction Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

rdkit/rdkit#9343 · 3 comentarios · 1 reacción · Abierto el 10/6/2026
Several test suite failures in 2026.03.02 Abierto

bug

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

rdkit/rdkit#9313 · 20 comentarios · Abierto el 29/5/2026
Unexpected behavior of pattern matching with useChirality=True and recursive SMARTS Abierto

bug

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 52/100

rdkit/rdkit#9247 · 3 comentarios · Abierto el 23/4/2026
no macrocyclic torsions found in symmetric rings Abierto

bug stale

rdkit/rdkit#9200 · 2 comentarios · 1 asignado · Abierto el 23/3/2026
ChemDraw fails to compile with newer LLVM/Clang versions Abierto

bug

rdkit/rdkit#9094 · 14 comentarios · 1 asignado · Abierto el 6/2/2026
Documentation for SubstructLibrary.get_matches should be explicit that the default number of max matches is 1000 Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

rdkit/rdkit-js#586 · Abierto el 18/11/2025
Supporting RDKit PosrgreSQL extension Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

rdkit/mmpdb#76 · 1 comentario · Abierto el 14/5/2025
Support for postgresql Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

rdkit/mmpdb#75 · Abierto el 14/5/2025
Expose a method to generate a scaffold from SMILES Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

rdkit/rdkit-js#539 · 1 comentario · Abierto el 27/3/2025
Specify more precise names for similarities in RDKit Abierto

documentation enhancement stale

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

rdkit/rdkit#8317 · 15 comentarios · Abierto el 2/3/2025
Enrichment factor returns empty list Abierto

bug

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 52/100

rdkit/rdkit#7981 · 7 comentarios · Abierto el 3/11/2024
Would it be possible to expose the MCSS, MMPA and fragmentation routines that are behind flags in MinimalLib compilation? Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

rdkit/rdkit-js#503 · Abierto el 29/10/2024
Support for double-cut linkers with 0 atoms Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

rdkit/mmpdb#64 · 1 comentario · Abierto el 17/10/2024
Molfile with SuperAtoms render shows a disconnected superAtom group at the corner Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

rdkit/rdkit-js#500 · Abierto el 16/10/2024
Bug with assigning stereochemistry in multiprocessing Abierto

bug stale

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 50/100

rdkit/rdkit#7917 · 6 comentarios · Abierto el 14/10/2024
Unexpected results from Generate Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

rdkit/mmpdb#63 · Abierto el 29/9/2024
Properties are not extracted from SDF files Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

rdkit/rdkit-js#489 · 3 comentarios · Abierto el 17/9/2024
Embed Molecule numerical instability edge case? Abierto

bug stale

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 52/100

rdkit/rdkit#7726 · 6 comentarios · Abierto el 18/8/2024
`-Wdocumentation` error Abierto

bug

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 73/100

rdkit/rdkit#7525 · 8 comentarios · Abierto el 15/6/2024
ACS1996 drawing Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

rdkit/rdkit-js#474 · 1 reacción · Abierto el 14/6/2024
Is it possible to change bond line color ? Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

rdkit/rdkit-js#467 · Abierto el 3/5/2024
Uncaught error for qmol get_svg() Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

rdkit/rdkit-js#451 · Abierto el 14/3/2024
It is not possible to obtain an InChI Key from a molecule with the same options as in Python Abierto

rdkit/rdkit-js#449 · 1 comentario · 1 asignado · Abierto el 12/3/2024
Bond Labels Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

rdkit/rdkit-js#447 · Abierto el 3/2/2024
Hiding formal charges Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

rdkit/rdkit-js#418 · Abierto el 15/11/2023
How to use get_mol() on pdb proteins? Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

rdkit/rdkit-js#416 · 4 comentarios · Abierto el 4/11/2023
Handle compressed WASM file? Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

rdkit/rdkit-js#404 · Abierto el 31/10/2023

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