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rdkit
The official sources for the RDKit library

HTML · 3591 个 star
mmpdb
A package to identify matched molecular pairs and use them to predict property changes.

Python · 301 个 star
rdkit-js
A powerful cheminformatics and molecule rendering toolbelt for JavaScript, powered by RDKit .

SCSS · 248 个 star
UGM_2026
Repository for the 2026 RDKit UGM

19 个 star

适合新手全部

未关闭全部

MOL2: UNITY_ATOM_ATTR section prevents correct formal charge assignment 未关闭

bug

难度 3/5 1-2 天新手友好度 70/100

rdkit/rdkit#9634 · 2026年9月23日创建
CalcNumAtomStereoCenters() changes after identity RenumberAtoms() on bicyclic amines 未关闭

bug

难度 4/5 3-5 天新手友好度 65/100

rdkit/rdkit#9629 · 2026年9月19日创建
Clarify mol_from_smiles vs qmol_from_smarts for substruct_count queries in Postgresql cartridge 未关闭

enhancement

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 86/100

rdkit/rdkit#9624 · 2026年9月18日创建
Add mol_numatoms/mol_numheavyatoms support for qmol in Postgresql cartridge 未关闭

enhancement

难度 4/5 3-5 天新手友好度 50/100

rdkit/rdkit#9623 · 2026年9月18日创建
Improve depiction of RNA 未关闭

enhancement

难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

rdkit/rdkit#9617 · 2026年9月18日创建
Depiction code doesn't recognize AtomAtomicNum as a list query 未关闭

bug

难度 3/5 1-2 天新手友好度 72/100

rdkit/rdkit#9607 · 2026年9月17日创建
MolsFromChemDrawBlock needs a version with explicit AUTO/CDX/CDXML support 未关闭

enhancement

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/rdkit#9604 · 2026年9月16日创建
Tracking: nanobind wrapper improvements 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

rdkit/rdkit#9601 · 2026年9月16日创建
MolToInchi adds spurious /b stereo for symmetric ylidene with 2D coordinates 未关闭

bug

难度 4/5 3-5 天新手友好度 48/100

rdkit/rdkit#9586 · 2026年9月15日创建
rdkit reports "Explicit valence for atom # 0 S, 7, is greater than permitted" for six-valent sulfur? 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 55/100

rdkit/rdkit#9581 · 6 条评论 · 2026年9月11日创建
Conflicting prototypes for function distdriver() 未关闭

bug

难度 3/5 1-2 天新手友好度 72/100

rdkit/rdkit#9575 · 3 条评论 · 2026年9月9日创建
Add context managers to handle config options in python tests 未关闭

enhancement

难度 3/5 1-2 天新手友好度 30/100

rdkit/rdkit#9559 · 2026年9月2日创建
Enable Link-Time-Optimization for production builds 未关闭

enhancement

难度 4/5 3-5 天新手友好度 48/100

rdkit/rdkit#9554 · 3 条评论 · 2026年8月31日创建
Build Fails on AMD system 未关闭

bug

难度 3/5 1-2 天新手友好度 57/100

rdkit/rdkit#9548 · 1 条评论 · 2026年8月30日创建
Shipped rdkit-stubs .pyi files are not valid Python, which stops mypy before it checks any user code 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

rdkit/rdkit#9540 · 1 条评论 · 2026年8月29日创建
Ubsan reports Division by zero in some tests 未关闭

bug

难度 3/5 1-2 天新手友好度 68/100

rdkit/rdkit#9530 · 1 条评论 · 2026年8月25日创建
Bug in sascorer due to discontinuity in smoothing function 未关闭

bug

难度 3/5 1-2 天新手友好度 68/100

rdkit/rdkit#9524 · 7 条评论 · 2026年8月21日创建
Incremental Smiles Parsing + Sanitization improvements 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/rdkit#9475 · 1 条评论 · 1 个 reaction · 2026年8月9日创建
Unexpected behavior of ResonanceMolSupplier 未关闭

bug

难度 4/5 3-5 天新手友好度 52/100

rdkit/rdkit#9458 · 2026年8月5日创建
Link to Visitor Registration 未关闭

难度 1/5 1 小时以内新手友好度 92/100

rdkit/UGM_2026#3 · 2026年7月25日创建
Enantiomeric flipping in spiro compound with chiral ammonium 未关闭

bug

难度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

rdkit/rdkit#9391 · 4 条评论 · 1 个 reaction · 2026年7月10日创建
CDXML reading doesn't use "bold" or "undirectional" hash bonds for stereochemistry 未关闭

bug

难度 4/5 3-5 天新手友好度 48/100

rdkit/rdkit#9359 · 3 条评论 · 2026年6月15日创建
FindPotentialStereo missing from Java Wrappers 未关闭

enhancement stale

难度 4/5 3-5 天新手友好度 65/100

rdkit/rdkit#9350 · 2 条评论 · 2026年6月11日创建
Constraints for bond lenghts, angles and torsion during bounds matrix construction 未关闭

enhancement

难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

rdkit/rdkit#9343 · 3 条评论 · 1 个 reaction · 2026年6月10日创建
Several test suite failures in 2026.03.02 未关闭

bug

难度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

rdkit/rdkit#9313 · 20 条评论 · 2026年5月29日创建
Unexpected behavior of pattern matching with useChirality=True and recursive SMARTS 未关闭

bug

难度 4/5 3-5 天新手友好度 52/100

rdkit/rdkit#9247 · 3 条评论 · 2026年4月23日创建
no macrocyclic torsions found in symmetric rings 未关闭

bug stale

rdkit/rdkit#9200 · 2 条评论 · 已指派 1 人 · 2026年3月23日创建
ChemDraw fails to compile with newer LLVM/Clang versions 未关闭

bug

rdkit/rdkit#9094 · 14 条评论 · 已指派 1 人 · 2026年2月6日创建
Documentation for SubstructLibrary.get_matches should be explicit that the default number of max matches is 1000 未关闭

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 45/100

rdkit/rdkit-js#586 · 2025年11月18日创建
Supporting RDKit PosrgreSQL extension 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

rdkit/mmpdb#76 · 1 条评论 · 2025年5月14日创建
Support for postgresql 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 30/100

rdkit/mmpdb#75 · 2025年5月14日创建
Expose a method to generate a scaffold from SMILES 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 38/100

rdkit/rdkit-js#539 · 1 条评论 · 2025年3月27日创建
Specify more precise names for similarities in RDKit 未关闭

documentation enhancement stale

难度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

rdkit/rdkit#8317 · 15 条评论 · 2025年3月2日创建
Enrichment factor returns empty list 未关闭

bug

难度 3/5 1-2 天新手友好度 52/100

rdkit/rdkit#7981 · 7 条评论 · 2024年11月3日创建
Would it be possible to expose the MCSS, MMPA and fragmentation routines that are behind flags in MinimalLib compilation? 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

rdkit/rdkit-js#503 · 2024年10月29日创建
Support for double-cut linkers with 0 atoms 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/mmpdb#64 · 1 条评论 · 2024年10月17日创建
Molfile with SuperAtoms render shows a disconnected superAtom group at the corner 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/rdkit-js#500 · 2024年10月16日创建
Bug with assigning stereochemistry in multiprocessing 未关闭

bug stale

难度 4/5 3-5 天新手友好度 50/100

rdkit/rdkit#7917 · 6 条评论 · 2024年10月14日创建
Unexpected results from Generate 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/mmpdb#63 · 2024年9月29日创建
Properties are not extracted from SDF files 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

rdkit/rdkit-js#489 · 3 条评论 · 2024年9月17日创建
Embed Molecule numerical instability edge case? 未关闭

bug stale

难度 4/5 3-5 天新手友好度 52/100

rdkit/rdkit#7726 · 6 条评论 · 2024年8月18日创建
`-Wdocumentation` error 未关闭

bug

难度 3/5 1-2 天新手友好度 73/100

rdkit/rdkit#7525 · 8 条评论 · 2024年6月15日创建
ACS1996 drawing 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

rdkit/rdkit-js#474 · 1 个 reaction · 2024年6月14日创建
Is it possible to change bond line color ? 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/rdkit-js#467 · 2024年5月3日创建
Uncaught error for qmol get_svg() 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 42/100

rdkit/rdkit-js#451 · 2024年3月14日创建
It is not possible to obtain an InChI Key from a molecule with the same options as in Python 未关闭

rdkit/rdkit-js#449 · 1 条评论 · 已指派 1 人 · 2024年3月12日创建
Bond Labels 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/rdkit-js#447 · 2024年2月3日创建
Hiding formal charges 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/rdkit-js#418 · 2023年11月15日创建
How to use get_mol() on pdb proteins? 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 25/100

rdkit/rdkit-js#416 · 4 条评论 · 2023年11月4日创建
Handle compressed WASM file? 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

rdkit/rdkit-js#404 · 2023年10月31日创建

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