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rdkit

索引済みのリポジトリ 4 件 · GitHub で見る

rdkit
The official sources for the RDKit library

HTML · スター 3591 個
mmpdb
A package to identify matched molecular pairs and use them to predict property changes.

Python · スター 301 個
rdkit-js
A powerful cheminformatics and molecule rendering toolbelt for JavaScript, powered by RDKit .

SCSS · スター 248 個
UGM_2026
Repository for the 2026 RDKit UGM

スター 19 個

初心者向けすべて

オープンすべて

MOL2: UNITY_ATOM_ATTR section prevents correct formal charge assignment オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 70/100

rdkit/rdkit#9634 · 2026年9月23日に作成
CalcNumAtomStereoCenters() changes after identity RenumberAtoms() on bicyclic amines オープン

bug

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 65/100

rdkit/rdkit#9629 · 2026年9月19日に作成
Clarify mol_from_smiles vs qmol_from_smarts for substruct_count queries in Postgresql cartridge オープン

enhancement

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 86/100

rdkit/rdkit#9624 · 2026年9月18日に作成
Add mol_numatoms/mol_numheavyatoms support for qmol in Postgresql cartridge オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 50/100

rdkit/rdkit#9623 · 2026年9月18日に作成
Improve depiction of RNA オープン

enhancement

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

rdkit/rdkit#9617 · 2026年9月18日に作成
Depiction code doesn't recognize AtomAtomicNum as a list query オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 72/100

rdkit/rdkit#9607 · 2026年9月17日に作成
MolsFromChemDrawBlock needs a version with explicit AUTO/CDX/CDXML support オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

rdkit/rdkit#9604 · 2026年9月16日に作成
Tracking: nanobind wrapper improvements オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

rdkit/rdkit#9601 · 2026年9月16日に作成
MolToInchi adds spurious /b stereo for symmetric ylidene with 2D coordinates オープン

bug

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 48/100

rdkit/rdkit#9586 · 2026年9月15日に作成
rdkit reports "Explicit valence for atom # 0 S, 7, is greater than permitted" for six-valent sulfur? オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 55/100

rdkit/rdkit#9581 · コメント 6 件 · 2026年9月11日に作成
Conflicting prototypes for function distdriver() オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 72/100

rdkit/rdkit#9575 · コメント 3 件 · 2026年9月9日に作成
Add context managers to handle config options in python tests オープン

enhancement

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 30/100

rdkit/rdkit#9559 · 2026年9月2日に作成
Enable Link-Time-Optimization for production builds オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 48/100

rdkit/rdkit#9554 · コメント 3 件 · 2026年8月31日に作成
Build Fails on AMD system オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 57/100

rdkit/rdkit#9548 · コメント 1 件 · 2026年8月30日に作成
Shipped rdkit-stubs .pyi files are not valid Python, which stops mypy before it checks any user code オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 45/100

rdkit/rdkit#9540 · コメント 1 件 · 2026年8月29日に作成
Ubsan reports Division by zero in some tests オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 68/100

rdkit/rdkit#9530 · コメント 1 件 · 2026年8月25日に作成
Bug in sascorer due to discontinuity in smoothing function オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 68/100

rdkit/rdkit#9524 · コメント 7 件 · 2026年8月21日に作成
Incremental Smiles Parsing + Sanitization improvements オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

rdkit/rdkit#9475 · コメント 1 件 · リアクション 1 件 · 2026年8月9日に作成
Unexpected behavior of ResonanceMolSupplier オープン

bug

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 52/100

rdkit/rdkit#9458 · 2026年8月5日に作成
Link to Visitor Registration オープン

難易度 1/5 1時間未満初心者へのやさしさ 92/100

rdkit/UGM_2026#3 · 2026年7月25日に作成
Enantiomeric flipping in spiro compound with chiral ammonium オープン

bug

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 45/100

rdkit/rdkit#9391 · コメント 4 件 · リアクション 1 件 · 2026年7月10日に作成
CDXML reading doesn't use "bold" or "undirectional" hash bonds for stereochemistry オープン

bug

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 48/100

rdkit/rdkit#9359 · コメント 3 件 · 2026年6月15日に作成
FindPotentialStereo missing from Java Wrappers オープン

enhancement stale

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 65/100

rdkit/rdkit#9350 · コメント 2 件 · 2026年6月11日に作成
Constraints for bond lenghts, angles and torsion during bounds matrix construction オープン

enhancement

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 35/100

rdkit/rdkit#9343 · コメント 3 件 · リアクション 1 件 · 2026年6月10日に作成
Several test suite failures in 2026.03.02 オープン

bug

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 45/100

rdkit/rdkit#9313 · コメント 20 件 · 2026年5月29日に作成
Unexpected behavior of pattern matching with useChirality=True and recursive SMARTS オープン

bug

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 52/100

rdkit/rdkit#9247 · コメント 3 件 · 2026年4月23日に作成
no macrocyclic torsions found in symmetric rings オープン

bug stale

rdkit/rdkit#9200 · コメント 2 件 · 担当者 1 名 · 2026年3月23日に作成
ChemDraw fails to compile with newer LLVM/Clang versions オープン

bug

rdkit/rdkit#9094 · コメント 14 件 · 担当者 1 名 · 2026年2月6日に作成
Documentation for SubstructLibrary.get_matches should be explicit that the default number of max matches is 1000 オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 45/100

rdkit/rdkit-js#586 · 2025年11月18日に作成
Supporting RDKit PosrgreSQL extension オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

rdkit/mmpdb#76 · コメント 1 件 · 2025年5月14日に作成
Support for postgresql オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 30/100

rdkit/mmpdb#75 · 2025年5月14日に作成
Expose a method to generate a scaffold from SMILES オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 38/100

rdkit/rdkit-js#539 · コメント 1 件 · 2025年3月27日に作成
Specify more precise names for similarities in RDKit オープン

documentation enhancement stale

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 45/100

rdkit/rdkit#8317 · コメント 15 件 · 2025年3月2日に作成
Enrichment factor returns empty list オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 52/100

rdkit/rdkit#7981 · コメント 7 件 · 2024年11月3日に作成
Would it be possible to expose the MCSS, MMPA and fragmentation routines that are behind flags in MinimalLib compilation? オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

rdkit/rdkit-js#503 · 2024年10月29日に作成
Support for double-cut linkers with 0 atoms オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

rdkit/mmpdb#64 · コメント 1 件 · 2024年10月17日に作成
Molfile with SuperAtoms render shows a disconnected superAtom group at the corner オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

rdkit/rdkit-js#500 · 2024年10月16日に作成
Bug with assigning stereochemistry in multiprocessing オープン

bug stale

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 50/100

rdkit/rdkit#7917 · コメント 6 件 · 2024年10月14日に作成
Unexpected results from Generate オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

rdkit/mmpdb#63 · 2024年9月29日に作成
Properties are not extracted from SDF files オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

rdkit/rdkit-js#489 · コメント 3 件 · 2024年9月17日に作成
Embed Molecule numerical instability edge case? オープン

bug stale

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 52/100

rdkit/rdkit#7726 · コメント 6 件 · 2024年8月18日に作成
`-Wdocumentation` error オープン

bug

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 73/100

rdkit/rdkit#7525 · コメント 8 件 · 2024年6月15日に作成
ACS1996 drawing オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

rdkit/rdkit-js#474 · リアクション 1 件 · 2024年6月14日に作成
Is it possible to change bond line color ? オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

rdkit/rdkit-js#467 · 2024年5月3日に作成
Uncaught error for qmol get_svg() オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 42/100

rdkit/rdkit-js#451 · 2024年3月14日に作成
It is not possible to obtain an InChI Key from a molecule with the same options as in Python オープン

rdkit/rdkit-js#449 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 · 2024年3月12日に作成
Bond Labels オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

rdkit/rdkit-js#447 · 2024年2月3日に作成
Hiding formal charges オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

rdkit/rdkit-js#418 · 2023年11月15日に作成
How to use get_mol() on pdb proteins? オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 25/100

rdkit/rdkit-js#416 · コメント 4 件 · 2023年11月4日に作成
Handle compressed WASM file? オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

rdkit/rdkit-js#404 · 2023年10月31日に作成

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