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rdkit

已索引 4 個儲存庫 · 在 GitHub 檢視

rdkit
The official sources for the RDKit library

HTML · 3591 個 star
mmpdb
A package to identify matched molecular pairs and use them to predict property changes.

Python · 301 個 star
rdkit-js
A powerful cheminformatics and molecule rendering toolbelt for JavaScript, powered by RDKit .

SCSS · 248 個 star
UGM_2026
Repository for the 2026 RDKit UGM

19 個 star

適合新手全部

未關閉全部

MOL2: UNITY_ATOM_ATTR section prevents correct formal charge assignment 未關閉

bug

難度 3/5 1-2 天新手友好度 70/100

rdkit/rdkit#9634 · 2026年9月23日建立
CalcNumAtomStereoCenters() changes after identity RenumberAtoms() on bicyclic amines 未關閉

bug

難度 4/5 3-5 天新手友好度 65/100

rdkit/rdkit#9629 · 2026年9月19日建立
Clarify mol_from_smiles vs qmol_from_smarts for substruct_count queries in Postgresql cartridge 未關閉

enhancement

難度 2/5 1-3 小時新手友好度 86/100

rdkit/rdkit#9624 · 2026年9月18日建立
Add mol_numatoms/mol_numheavyatoms support for qmol in Postgresql cartridge 未關閉

enhancement

難度 4/5 3-5 天新手友好度 50/100

rdkit/rdkit#9623 · 2026年9月18日建立
Improve depiction of RNA 未關閉

enhancement

難度 5/5 一週以上新手友好度 35/100

rdkit/rdkit#9617 · 2026年9月18日建立
Depiction code doesn't recognize AtomAtomicNum as a list query 未關閉

bug

難度 3/5 1-2 天新手友好度 72/100

rdkit/rdkit#9607 · 2026年9月17日建立
MolsFromChemDrawBlock needs a version with explicit AUTO/CDX/CDXML support 未關閉

enhancement

難度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/rdkit#9604 · 2026年9月16日建立
Tracking: nanobind wrapper improvements 未關閉

難度 5/5 一週以上新手友好度 25/100

rdkit/rdkit#9601 · 2026年9月16日建立
MolToInchi adds spurious /b stereo for symmetric ylidene with 2D coordinates 未關閉

bug

難度 4/5 3-5 天新手友好度 48/100

rdkit/rdkit#9586 · 2026年9月15日建立
rdkit reports "Explicit valence for atom # 0 S, 7, is greater than permitted" for six-valent sulfur? 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 55/100

rdkit/rdkit#9581 · 6 則留言 · 2026年9月11日建立
Conflicting prototypes for function distdriver() 未關閉

bug

難度 3/5 1-2 天新手友好度 72/100

rdkit/rdkit#9575 · 3 則留言 · 2026年9月9日建立
Add context managers to handle config options in python tests 未關閉

enhancement

難度 3/5 1-2 天新手友好度 30/100

rdkit/rdkit#9559 · 2026年9月2日建立
Enable Link-Time-Optimization for production builds 未關閉

enhancement

難度 4/5 3-5 天新手友好度 48/100

rdkit/rdkit#9554 · 3 則留言 · 2026年8月31日建立
Build Fails on AMD system 未關閉

bug

難度 3/5 1-2 天新手友好度 57/100

rdkit/rdkit#9548 · 1 則留言 · 2026年8月30日建立
Shipped rdkit-stubs .pyi files are not valid Python, which stops mypy before it checks any user code 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

rdkit/rdkit#9540 · 1 則留言 · 2026年8月29日建立
Ubsan reports Division by zero in some tests 未關閉

bug

難度 3/5 1-2 天新手友好度 68/100

rdkit/rdkit#9530 · 1 則留言 · 2026年8月25日建立
Bug in sascorer due to discontinuity in smoothing function 未關閉

bug

難度 3/5 1-2 天新手友好度 68/100

rdkit/rdkit#9524 · 7 則留言 · 2026年8月21日建立
Incremental Smiles Parsing + Sanitization improvements 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/rdkit#9475 · 1 則留言 · 1 個 reaction · 2026年8月9日建立
Unexpected behavior of ResonanceMolSupplier 未關閉

bug

難度 4/5 3-5 天新手友好度 52/100

rdkit/rdkit#9458 · 2026年8月5日建立
Link to Visitor Registration 未關閉

難度 1/5 1 小時以內新手友好度 92/100

rdkit/UGM_2026#3 · 2026年7月25日建立
Enantiomeric flipping in spiro compound with chiral ammonium 未關閉

bug

難度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

rdkit/rdkit#9391 · 4 則留言 · 1 個 reaction · 2026年7月10日建立
CDXML reading doesn't use "bold" or "undirectional" hash bonds for stereochemistry 未關閉

bug

難度 4/5 3-5 天新手友好度 48/100

rdkit/rdkit#9359 · 3 則留言 · 2026年6月15日建立
FindPotentialStereo missing from Java Wrappers 未關閉

enhancement stale

難度 4/5 3-5 天新手友好度 65/100

rdkit/rdkit#9350 · 2 則留言 · 2026年6月11日建立
Constraints for bond lenghts, angles and torsion during bounds matrix construction 未關閉

enhancement

難度 5/5 一週以上新手友好度 35/100

rdkit/rdkit#9343 · 3 則留言 · 1 個 reaction · 2026年6月10日建立
Several test suite failures in 2026.03.02 未關閉

bug

難度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

rdkit/rdkit#9313 · 20 則留言 · 2026年5月29日建立
Unexpected behavior of pattern matching with useChirality=True and recursive SMARTS 未關閉

bug

難度 4/5 3-5 天新手友好度 52/100

rdkit/rdkit#9247 · 3 則留言 · 2026年4月23日建立
no macrocyclic torsions found in symmetric rings 未關閉

bug stale

rdkit/rdkit#9200 · 2 則留言 · 已指派 1 人 · 2026年3月23日建立
ChemDraw fails to compile with newer LLVM/Clang versions 未關閉

bug

rdkit/rdkit#9094 · 14 則留言 · 已指派 1 人 · 2026年2月6日建立
Documentation for SubstructLibrary.get_matches should be explicit that the default number of max matches is 1000 未關閉

難度 2/5 1-3 小時新手友好度 45/100

rdkit/rdkit-js#586 · 2025年11月18日建立
Supporting RDKit PosrgreSQL extension 未關閉

難度 5/5 一週以上新手友好度 25/100

rdkit/mmpdb#76 · 1 則留言 · 2025年5月14日建立
Support for postgresql 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 30/100

rdkit/mmpdb#75 · 2025年5月14日建立
Expose a method to generate a scaffold from SMILES 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 38/100

rdkit/rdkit-js#539 · 1 則留言 · 2025年3月27日建立
Specify more precise names for similarities in RDKit 未關閉

documentation enhancement stale

難度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

rdkit/rdkit#8317 · 15 則留言 · 2025年3月2日建立
Enrichment factor returns empty list 未關閉

bug

難度 3/5 1-2 天新手友好度 52/100

rdkit/rdkit#7981 · 7 則留言 · 2024年11月3日建立
Would it be possible to expose the MCSS, MMPA and fragmentation routines that are behind flags in MinimalLib compilation? 未關閉

難度 5/5 一週以上新手友好度 25/100

rdkit/rdkit-js#503 · 2024年10月29日建立
Support for double-cut linkers with 0 atoms 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/mmpdb#64 · 1 則留言 · 2024年10月17日建立
Molfile with SuperAtoms render shows a disconnected superAtom group at the corner 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/rdkit-js#500 · 2024年10月16日建立
Bug with assigning stereochemistry in multiprocessing 未關閉

bug stale

難度 4/5 3-5 天新手友好度 50/100

rdkit/rdkit#7917 · 6 則留言 · 2024年10月14日建立
Unexpected results from Generate 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/mmpdb#63 · 2024年9月29日建立
Properties are not extracted from SDF files 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

rdkit/rdkit-js#489 · 3 則留言 · 2024年9月17日建立
Embed Molecule numerical instability edge case? 未關閉

bug stale

難度 4/5 3-5 天新手友好度 52/100

rdkit/rdkit#7726 · 6 則留言 · 2024年8月18日建立
`-Wdocumentation` error 未關閉

bug

難度 3/5 1-2 天新手友好度 73/100

rdkit/rdkit#7525 · 8 則留言 · 2024年6月15日建立
ACS1996 drawing 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

rdkit/rdkit-js#474 · 1 個 reaction · 2024年6月14日建立
Is it possible to change bond line color ? 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/rdkit-js#467 · 2024年5月3日建立
Uncaught error for qmol get_svg() 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 42/100

rdkit/rdkit-js#451 · 2024年3月14日建立
It is not possible to obtain an InChI Key from a molecule with the same options as in Python 未關閉

rdkit/rdkit-js#449 · 1 則留言 · 已指派 1 人 · 2024年3月12日建立
Bond Labels 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/rdkit-js#447 · 2024年2月3日建立
Hiding formal charges 未關閉

難度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

rdkit/rdkit-js#418 · 2023年11月15日建立
How to use get_mol() on pdb proteins? 未關閉

難度 3/5 1-2 天新手友好度 25/100

rdkit/rdkit-js#416 · 4 則留言 · 2023年11月4日建立
Handle compressed WASM file? 未關閉

難度 5/5 一週以上新手友好度 25/100

rdkit/rdkit-js#404 · 2023年10月31日建立

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