cytomining

Las issues en las que quizá ya trabaja alguien aparecen al final. Ordenar todo por fecha

• Support Python 3.13+

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  cytomining/copairs#145 · 1 comentario · Abierto el 28/9/2026

• Feature request: export`feature_select_columns` file from `feature_select` instead of full profile

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  cytomining/pycytominer#759 · 1 comentario · Abierto el 9/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Add column categorization enhancements

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

  cytomining/CytoDataFrame#230 · Abierto el 3/9/2026

• Reordering `drop_na_columns` before other `feature_select` operations lead to 2–6x speedup on profiles

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  cytomining/pycytominer#756 · Abierto el 2/9/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Enable remote SQLite references

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  cytomining/CytoTable#485 · Abierto el 7/7/2026

• NameError: Cytotable not defined

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  cytomining/CytoTable#476 · 3 comentarios · Abierto el 22/6/2026

• Deprecating legacy API

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  cytomining/pycytominer#705 · Abierto el 5/6/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Find a way for users to avoid SQL configurations

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  cytomining/CytoTable#454 · 1 comentario · Abierto el 13/5/2026

• Delete plotly dependency

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  cytomining/copairs#129 · Abierto el 8/5/2026

• FeatureRequest: Migrate Dependabot configuration to support `uv`

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  cytomining/pycytominer#667 · Abierto el 29/4/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Fix broken pypi deploy

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  cytomining/CytoDataFrame#211 · Abierto el 27/4/2026

• Question: How can we improve `annotate` by avoiding renaming of columns?

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  cytomining/pycytominer#660 · Abierto el 21/4/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Question: Best practices to limit CPU usage?

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  cytomining/CytoTable#437 · 5 comentarios · 1 reacción · Abierto el 14/4/2026

• Adding more presets as separate files or as one file similar to CytoTable?

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  cytomining/coSMicQC#329 · Abierto el 9/4/2026

• Simplify analyze.py by moving helper functions into separate script

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  cytomining/coSMicQC#328 · Abierto el 8/4/2026

• Remove temporary normalize() shim for string-encoded missing feature values

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  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 82/100

  cytomining/pycytominer#646 · Abierto el 1/4/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Enable CI docs environment to provision notebook dependencies

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  cytomining/pycytominer#645 · Abierto el 1/4/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Enable and/or document explicit CytoTable iceberg compatibility

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  cytomining/CytoDataFrame#207 · Abierto el 26/3/2026

• Refactor `convert.py` with greater modularity

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  cytomining/CytoTable#430 · Abierto el 26/3/2026

• Image features and important Metadata fields missing from parquets

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  cytomining/CytoTable#425 · 5 comentarios · Abierto el 19/3/2026

• Filter columns plots are hard to see with small values like z-scores

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  cytomining/CytoDataFrame#205 · Abierto el 17/3/2026

• Issue: `aggregate` function uses different parameter name for profiles than the rest of the main functions

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  cytomining/pycytominer#635 · Abierto el 9/3/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• FeatureRequest: Faster Correlation Computation (Correlation Threshold Feature Selection)

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  cytomining/pycytominer#633 · Abierto el 3/3/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Provide graceful message when no data can be displayed

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  cytomining/CytoDataFrame#197 · Abierto el 2/3/2026

• Provide DataFrame row filtering based on column min and max thresholds

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  cytomining/CytoDataFrame#196 · Abierto el 2/3/2026

• Ensure image adjustments work for OME-Arrow derived visualizations

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  cytomining/CytoDataFrame#194 · Abierto el 17/2/2026

• Adjust cytodataframe styling for use with Google Colab

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  cytomining/CytoDataFrame#193 · Abierto el 17/2/2026

• Address `format_broad_cmap` and `clean_cellprofiler` tight coupling

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  cytomining/pycytominer#625 · Abierto el 13/2/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Address automatic inference of output file type using filenames (CLI and core functions)

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  cytomining/pycytominer#624 · Abierto el 13/2/2026

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• Enable the use of arbitrary filepaths or arrays for use in image rendering with CDF instantiation

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  cytomining/CytoDataFrame#184 · Abierto el 5/2/2026

• Add optional parameters to return pandas dataframe

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  cytomining/coSMicQC#304 · Abierto el 27/1/2026

• Check for empty or zero row tables (provide specific warning)

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  cytomining/CytoTable#409 · Abierto el 23/1/2026

• Add vortex file input / output capabilities

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  cytomining/CytoDataFrame#176 · Abierto el 6/1/2026

• Implement declarative `ruff` and `ruff format` linting

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  cytomining/copairs#121 · 2 comentarios · Abierto el 6/1/2026

• Tie all bounding boxes to relevant images

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  cytomining/CytoDataFrame#163 · Abierto el 21/11/2025

• Enable boundingbox cols to have "metadata" in the field name

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  cytomining/CytoDataFrame#158 · Abierto el 6/11/2025

• Handle multi-channel images

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  cytomining/CytoDataFrame#155 · Abierto el 4/11/2025

• Confirm CDF works with Marimo notebooks

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  cytomining/CytoDataFrame#154 · Abierto el 4/11/2025

• compute exact p-value for small null configs

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  cytomining/copairs#105 · Abierto el 28/10/2025

• Create dedicated filtering function

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  cytomining/coSMicQC#268 · 1 comentario · Abierto el 20/10/2025

• np.unique now supports `sorted` param in future. Be explicit about it.

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  cytomining/copairs#102 · Abierto el 14/10/2025

• Fail to summarize across plate

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  cytomining/CytoTable#377 · 3 comentarios · 1 reacción · Abierto el 6/10/2025

• Can't run examplehuman

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  cytomining/CytoTable#374 · 7 comentarios · Abierto el 3/10/2025

• Add image scale display option labels (indicating measurement within images)

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  cytomining/CytoDataFrame#138 · Abierto el 30/9/2025

• Consider use of `pyarrow.lib.RecordBatchReader` for internal streamable data handling

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  cytomining/CytoTable#371 · Abierto el 30/9/2025

• Using compartments to input CSVs with custom names

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  cytomining/CytoTable#362 · 6 comentarios · Abierto el 10/9/2025

• Implement lazy file reader capabilities

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  cytomining/pycytominer#576 · Abierto el 5/9/2025

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• How to handle data from multiple projects?

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  cytomining/coSMicQC#254 · Abierto el 4/9/2025

• FeatureRequest: enable mulitple dataframe support

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  cytomining/pycytominer#574 · 3 comentarios · Abierto el 2/9/2025

  Los mantenedores suelen responder en 1 día

• New CytoTable preset?

  Quizá libre de nuevo @d33bs la tomó hace 391 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

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  cytomining/CytoTable#358 · 2 comentarios · 1 asignado · Abierto el 2/9/2025