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Support Python 3.13+
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 84/100

cytomining/copairs#145 · 1 commento · Aperta il 28/9/2026
Feature request: export`feature_select_columns` file from `feature_select` instead of full profile
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

cytomining/pycytominer#759 · 1 commento · Aperta il 9/9/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Add column categorization enhancements
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

cytomining/CytoDataFrame#230 · Aperta il 3/9/2026
Reordering `drop_na_columns` before other `feature_select` operations lead to 2–6x speedup on profiles
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 52/100

cytomining/pycytominer#756 · Aperta il 2/9/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Enable remote SQLite references
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

cytomining/CytoTable#485 · Aperta il 7/7/2026
NameError: Cytotable not defined
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100

cytomining/CytoTable#476 · 3 commenti · Aperta il 22/6/2026
Deprecating legacy API
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

cytomining/pycytominer#705 · Aperta il 5/6/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Find a way for users to avoid SQL configurations
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 55/100

cytomining/CytoTable#454 · 1 commento · Aperta il 13/5/2026
Delete plotly dependency
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 68/100

cytomining/copairs#129 · Aperta il 8/5/2026
FeatureRequest: Migrate Dependabot configuration to support `uv`
Aperta
- Qualcosa non va?
enhancement

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 72/100

cytomining/pycytominer#667 · Aperta il 29/4/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Fix broken pypi deploy
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

cytomining/CytoDataFrame#211 · Aperta il 27/4/2026
Question: How can we improve `annotate` by avoiding renaming of columns?
Aperta
- Qualcosa non va?
enhancement question

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

cytomining/pycytominer#660 · Aperta il 21/4/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Question: Best practices to limit CPU usage?
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

cytomining/CytoTable#437 · 5 commenti · 1 reazione · Aperta il 14/4/2026
Adding more presets as separate files or as one file similar to CytoTable?
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

cytomining/coSMicQC#329 · Aperta il 9/4/2026
Simplify analyze.py by moving helper functions into separate script
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100

cytomining/coSMicQC#328 · Aperta il 8/4/2026
Remove temporary normalize() shim for string-encoded missing feature values
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 82/100

cytomining/pycytominer#646 · Aperta il 1/4/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Enable CI docs environment to provision notebook dependencies
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 52/100

cytomining/pycytominer#645 · Aperta il 1/4/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Enable and/or document explicit CytoTable iceberg compatibility
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100

cytomining/CytoDataFrame#207 · Aperta il 26/3/2026
Refactor `convert.py` with greater modularity
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

cytomining/CytoTable#430 · Aperta il 26/3/2026
Image features and important Metadata fields missing from parquets
Aperta
- Qualcosa non va?
question

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100

cytomining/CytoTable#425 · 5 commenti · Aperta il 19/3/2026
Filter columns plots are hard to see with small values like z-scores
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

cytomining/CytoDataFrame#205 · Aperta il 17/3/2026
Issue: `aggregate` function uses different parameter name for profiles than the rest of the main functions
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 38/100

cytomining/pycytominer#635 · Aperta il 9/3/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
FeatureRequest: Faster Correlation Computation (Correlation Threshold Feature Selection)
Aperta
- Qualcosa non va?
enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

cytomining/pycytominer#633 · Aperta il 3/3/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Provide graceful message when no data can be displayed
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

cytomining/CytoDataFrame#197 · Aperta il 2/3/2026
Provide DataFrame row filtering based on column min and max thresholds
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

cytomining/CytoDataFrame#196 · Aperta il 2/3/2026
Ensure image adjustments work for OME-Arrow derived visualizations
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

cytomining/CytoDataFrame#194 · Aperta il 17/2/2026
Adjust cytodataframe styling for use with Google Colab
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

cytomining/CytoDataFrame#193 · Aperta il 17/2/2026
Address `format_broad_cmap` and `clean_cellprofiler` tight coupling
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

cytomining/pycytominer#625 · Aperta il 13/2/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Address automatic inference of output file type using filenames (CLI and core functions)
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

cytomining/pycytominer#624 · Aperta il 13/2/2026

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Enable the use of arbitrary filepaths or arrays for use in image rendering with CDF instantiation
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

cytomining/CytoDataFrame#184 · Aperta il 5/2/2026
Add optional parameters to return pandas dataframe
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

cytomining/coSMicQC#304 · Aperta il 27/1/2026
Check for empty or zero row tables (provide specific warning)
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

cytomining/CytoTable#409 · Aperta il 23/1/2026
Add vortex file input / output capabilities
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

cytomining/CytoDataFrame#176 · Aperta il 6/1/2026
Implement declarative `ruff` and `ruff format` linting
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 58/100

cytomining/copairs#121 · 2 commenti · Aperta il 6/1/2026
Tie all bounding boxes to relevant images
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

cytomining/CytoDataFrame#163 · Aperta il 21/11/2025
Enable boundingbox cols to have "metadata" in the field name
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

cytomining/CytoDataFrame#158 · Aperta il 6/11/2025
Handle multi-channel images
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

cytomining/CytoDataFrame#155 · Aperta il 4/11/2025
Confirm CDF works with Marimo notebooks
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

cytomining/CytoDataFrame#154 · Aperta il 4/11/2025
compute exact p-value for small null configs
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100

cytomining/copairs#105 · Aperta il 28/10/2025
Create dedicated filtering function
Aperta
- Qualcosa non va?
enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

cytomining/coSMicQC#268 · 1 commento · Aperta il 20/10/2025
np.unique now supports `sorted` param in future. Be explicit about it.
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 52/100

cytomining/copairs#102 · Aperta il 14/10/2025
Fail to summarize across plate
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

cytomining/CytoTable#377 · 3 commenti · 1 reazione · Aperta il 6/10/2025
Can't run examplehuman
Aperta
- Qualcosa non va?
question

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

cytomining/CytoTable#374 · 7 commenti · Aperta il 3/10/2025
Add image scale display option labels (indicating measurement within images)
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

cytomining/CytoDataFrame#138 · Aperta il 30/9/2025
Consider use of `pyarrow.lib.RecordBatchReader` for internal streamable data handling
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

cytomining/CytoTable#371 · Aperta il 30/9/2025
Using compartments to input CSVs with custom names
Aperta
- Qualcosa non va?
question

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

cytomining/CytoTable#362 · 6 commenti · Aperta il 10/9/2025
Implement lazy file reader capabilities
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

cytomining/pycytominer#576 · Aperta il 5/9/2025

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
How to handle data from multiple projects?
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

cytomining/coSMicQC#254 · Aperta il 4/9/2025
FeatureRequest: enable mulitple dataframe support
Aperta
- Qualcosa non va?
Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

cytomining/pycytominer#574 · 3 commenti · Aperta il 2/9/2025

I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
New CytoTable preset?
Forse di nuovo libera @d33bs l’ha presa 392 giorni fa e non c’è nessuna pull request aperta. Aperta
- Qualcosa non va?
cytomining/CytoTable#358 · 2 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 2/9/2025

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