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Image-based Profiling Template

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Support Python 3.13+
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难度 2/5 1-3 小时新手友好度 84/100

cytomining/copairs#145 · 1 条评论 · 2026年9月28日创建
Feature request: export`feature_select_columns` file from `feature_select` instead of full profile
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 48/100

cytomining/pycytominer#759 · 1 条评论 · 2026年9月9日创建

维护者通常 1 天内回复
Add column categorization enhancements
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

cytomining/CytoDataFrame#230 · 2026年9月3日创建
Reordering `drop_na_columns` before other `feature_select` operations lead to 2–6x speedup on profiles
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 52/100

cytomining/pycytominer#756 · 2026年9月2日创建

维护者通常 1 天内回复
Enable remote SQLite references
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

cytomining/CytoTable#485 · 2026年7月7日创建
NameError: Cytotable not defined
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 48/100

cytomining/CytoTable#476 · 3 条评论 · 2026年6月22日创建
Deprecating legacy API
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

cytomining/pycytominer#705 · 2026年6月5日创建

维护者通常 1 天内回复
Find a way for users to avoid SQL configurations
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 55/100

cytomining/CytoTable#454 · 1 条评论 · 2026年5月13日创建
Delete plotly dependency
未关闭
- 哪里不对？
难度 2/5 1-3 小时新手友好度 68/100

cytomining/copairs#129 · 2026年5月8日创建
FeatureRequest: Migrate Dependabot configuration to support `uv`
未关闭
- 哪里不对？
enhancement

难度 1/5 1 小时以内新手友好度 72/100

cytomining/pycytominer#667 · 2026年4月29日创建

维护者通常 1 天内回复
Fix broken pypi deploy
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 45/100

cytomining/CytoDataFrame#211 · 2026年4月27日创建
Question: How can we improve `annotate` by avoiding renaming of columns?
未关闭
- 哪里不对？
enhancement question

难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

cytomining/pycytominer#660 · 2026年4月21日创建

维护者通常 1 天内回复
Question: Best practices to limit CPU usage?
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

cytomining/CytoTable#437 · 5 条评论 · 1 个 reaction · 2026年4月14日创建
Adding more presets as separate files or as one file similar to CytoTable?
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

cytomining/coSMicQC#329 · 2026年4月9日创建
Simplify analyze.py by moving helper functions into separate script
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 48/100

cytomining/coSMicQC#328 · 2026年4月8日创建
Remove temporary normalize() shim for string-encoded missing feature values
未关闭
- 哪里不对？
难度 2/5 1-3 小时新手友好度 82/100

cytomining/pycytominer#646 · 2026年4月1日创建

维护者通常 1 天内回复
Enable CI docs environment to provision notebook dependencies
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 52/100

cytomining/pycytominer#645 · 2026年4月1日创建

维护者通常 1 天内回复
Enable and/or document explicit CytoTable iceberg compatibility
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 38/100

cytomining/CytoDataFrame#207 · 2026年3月26日创建
Refactor `convert.py` with greater modularity
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

cytomining/CytoTable#430 · 2026年3月26日创建
Image features and important Metadata fields missing from parquets
未关闭
- 哪里不对？
question

难度 3/5 1-2 天新手友好度 48/100

cytomining/CytoTable#425 · 5 条评论 · 2026年3月19日创建
Filter columns plots are hard to see with small values like z-scores
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 20/100

cytomining/CytoDataFrame#205 · 2026年3月17日创建
Issue: `aggregate` function uses different parameter name for profiles than the rest of the main functions
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 38/100

cytomining/pycytominer#635 · 2026年3月9日创建

维护者通常 1 天内回复
FeatureRequest: Faster Correlation Computation (Correlation Threshold Feature Selection)
未关闭
- 哪里不对？
enhancement

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

cytomining/pycytominer#633 · 2026年3月3日创建

维护者通常 1 天内回复
Provide graceful message when no data can be displayed
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

cytomining/CytoDataFrame#197 · 2026年3月2日创建
Provide DataFrame row filtering based on column min and max thresholds
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 30/100

cytomining/CytoDataFrame#196 · 2026年3月2日创建
Ensure image adjustments work for OME-Arrow derived visualizations
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

cytomining/CytoDataFrame#194 · 2026年2月17日创建
Adjust cytodataframe styling for use with Google Colab
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 45/100

cytomining/CytoDataFrame#193 · 2026年2月17日创建
Address `format_broad_cmap` and `clean_cellprofiler` tight coupling
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 20/100

cytomining/pycytominer#625 · 2026年2月13日创建

维护者通常 1 天内回复
Address automatic inference of output file type using filenames (CLI and core functions)
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

cytomining/pycytominer#624 · 2026年2月13日创建

维护者通常 1 天内回复
Enable the use of arbitrary filepaths or arrays for use in image rendering with CDF instantiation
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

cytomining/CytoDataFrame#184 · 2026年2月5日创建
Add optional parameters to return pandas dataframe
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 45/100

cytomining/coSMicQC#304 · 2026年1月27日创建
Check for empty or zero row tables (provide specific warning)
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

cytomining/CytoTable#409 · 2026年1月23日创建
Add vortex file input / output capabilities
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 30/100

cytomining/CytoDataFrame#176 · 2026年1月6日创建
Implement declarative `ruff` and `ruff format` linting
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 58/100

cytomining/copairs#121 · 2 条评论 · 2026年1月6日创建
Tie all bounding boxes to relevant images
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

cytomining/CytoDataFrame#163 · 2025年11月21日创建
Enable boundingbox cols to have "metadata" in the field name
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

cytomining/CytoDataFrame#158 · 2025年11月6日创建
Handle multi-channel images
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

cytomining/CytoDataFrame#155 · 2025年11月4日创建
Confirm CDF works with Marimo notebooks
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

cytomining/CytoDataFrame#154 · 2025年11月4日创建
compute exact p-value for small null configs
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 48/100

cytomining/copairs#105 · 2025年10月28日创建
Create dedicated filtering function
未关闭
- 哪里不对？
enhancement

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

cytomining/coSMicQC#268 · 1 条评论 · 2025年10月20日创建
np.unique now supports `sorted` param in future. Be explicit about it.
未关闭
- 哪里不对？
难度 1/5 1 小时以内新手友好度 52/100

cytomining/copairs#102 · 2025年10月14日创建
Fail to summarize across plate
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

cytomining/CytoTable#377 · 3 条评论 · 1 个 reaction · 2025年10月6日创建
Can't run examplehuman
未关闭
- 哪里不对？
question

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

cytomining/CytoTable#374 · 7 条评论 · 2025年10月3日创建
Add image scale display option labels (indicating measurement within images)
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 25/100

cytomining/CytoDataFrame#138 · 2025年9月30日创建
Consider use of `pyarrow.lib.RecordBatchReader` for internal streamable data handling
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

cytomining/CytoTable#371 · 2025年9月30日创建
Using compartments to input CSVs with custom names
未关闭
- 哪里不对？
question

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

cytomining/CytoTable#362 · 6 条评论 · 2025年9月10日创建
Implement lazy file reader capabilities
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 30/100

cytomining/pycytominer#576 · 2025年9月5日创建

维护者通常 1 天内回复
How to handle data from multiple projects?
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

cytomining/coSMicQC#254 · 2025年9月4日创建
FeatureRequest: enable mulitple dataframe support
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

cytomining/pycytominer#574 · 3 条评论 · 2025年9月2日创建

维护者通常 1 天内回复
New CytoTable preset?
可能重新可做 @d33bs 于 391 天前认领，目前没有进行中的 PR。未关闭
- 哪里不对？
cytomining/CytoTable#358 · 2 条评论 · 已指派 1 人 · 2025年9月2日创建

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