Hacktoberfest 2026: los issues que los mantenedores marcaron para octubre, abiertos y aptos para principiantes. Explorar issues de Hacktoberfest

cytomining/DeepProfiler

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Morphological profiling using deep learning

¿Es cytomining/DeepProfiler apto para principiantes?

Hemos visto muy pocos pull requests recientes de colaboradores externos en cytomining/DeepProfiler para saber con qué frecuencia se fusionan. Ahora mismo no hay ningún issue apto para principiantes abierto; la lista de abajo muestra los demás issues que tenemos de este repositorio.

Estrellas
129
Forks
52
Issues abiertos para principiantes
0
Issues indexados
25
Merge medio
5 h 20 min
PR fusionados (30 d)
2
Lenguaje dominante
Python
Licencia
BSD-3-Clause
Último push a GitHub
2/9/2026
Última indexación
15/9/2026
Guía de contribución
Código de conducta
Etiquetas para principiantes
help wanted

Cómo contribuir a cytomining/DeepProfiler

  1. Lee primero la guía de contribución: explica cómo quieren los mantenedores que se propongan, prueben y revisen los cambios.
  2. Lee su código de conducta: se aplica a los issues y pull requests igual que al chat.
  3. Tus contribuciones se publicarán bajo la licencia BSD-3-Clause del proyecto.
  4. Sigue el repositorio para enterarte cuando se abra un nuevo issue apto para principiantes, o revisa los demás issues de abajo.
Para principiantes Todo
Abierto Todos

Las issues en las que quizá ya trabaja alguien aparecen al final. Ordenar todo por fecha

  • Request of clarifications about processed data in `cpg0019`
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    cytomining/DeepProfiler#360 · 5 comentarios ·

  • ValueError: Unexpectedly found an instance of type `<class 'keras.src.engine.keras_tensor.KerasTensor'>`. Expected a symbolic tensor instance.
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    cytomining/DeepProfiler#359 ·

  • DeepProfiler produces incorrect crops if provided with images of different sizes
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

    cytomining/DeepProfiler#355 · 1 comentario ·

  • What's your thoughts on plate/batch-wise whitening for batch effect?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    cytomining/DeepProfiler#352 · 3 comentarios ·

  • finetune the model you provided error
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    cytomining/DeepProfiler#347 · 3 comentarios ·

  • Speed up profiling
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

    cytomining/DeepProfiler#325 ·

  • Image names for full image crop generator are taken as is
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

    cytomining/DeepProfiler#322 ·

  • Merge metadata and outlines.
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

    cytomining/DeepProfiler#318 ·

  • Finalize transition to TFv2
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

    cytomining/DeepProfiler#317 · 4 comentarios ·

  • Old / unwanted commands?
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    cytomining/DeepProfiler#316 · 2 comentarios ·

  • Save location files in nested folder structures as well
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    cytomining/DeepProfiler#315 · 1 comentario ·

  • Port individual channel crop generator.
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    cytomining/DeepProfiler#313 · 1 asignado ·

  • TFv2 training time issue
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug enhancement

    cytomining/DeepProfiler#310 · 1 asignado ·

  • Port single image crop generator and profiling to TFv2
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    cytomining/DeepProfiler#309 · 1 asignado ·

  • Integrate online labels crop generator into traintf2
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    cytomining/DeepProfiler#308 · 1 asignado ·

  • Resume single cells export
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    cytomining/DeepProfiler#296 ·

  • Update the wiki
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    cytomining/DeepProfiler#289 · 3 comentarios · 1 asignado ·

  • Parameterize augmentations
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    cytomining/DeepProfiler#281 · 2 comentarios ·

  • Build helper functions
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    cytomining/DeepProfiler#262 · 1 comentario ·

  • Reading Location files gives unhelpful error
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 38/100

    cytomining/DeepProfiler#261 · 3 comentarios ·

  • Check coordinates of the boxes during cropping.
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug enhancement

    cytomining/DeepProfiler#258 · 1 reacción · 1 asignado ·

  • Document how to setup ec2 instance in AWS to run DeepProfiler
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    help wanted question

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

    cytomining/DeepProfiler#257 · 2 comentarios · 1 reacción ·

  • Performance metrics - report average class accuracy, rather than just accuracy.
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

    cytomining/DeepProfiler#239 ·

  • Cropping doesn't support multiple targets
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

    cytomining/DeepProfiler#136 · 1 comentario ·

  • Parameterize the use of pixel normalization
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

    cytomining/DeepProfiler#25 ·

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