Chủ sở hữu
cytomining
Đã lập chỉ mục 17 kho mã nguồn · Xem trên GitHub
-
pycytominer
Python package for image-based profiling
Python · 145 star
-
DeepProfiler
Morphological profiling using deep learning
Python · 129 star
-
cytominer
Methods for Image-Based Cell Profiling
R · 52 star
-
copairs
Find profile pairs and compute retrieval metrics between them.
Python · 24 star
-
CytoTable
Harmonize high-content image analysis tool outputs for processing with Pycytominer and other Cytomining tools.
Python · 22 star
-
CytoDataFrame
An in-memory data analysis format for single-cell profiles alongside their corresponding images and segmentation masks.
Python · 13 star
-
profiling-recipe
Image-based Profiling Recipe
Python · 11 star
-
profiling-handbook
Image-based Profiling Handbook
11 star
-
coSMicQC
Single cell Morphology Quality Control (coSMicQC)
Python · 11 star
-
cytominer-database
[DEPRECATED] A package for storing morphological profiling data.
Python · 10 star
-
DeepProfiler-handbook
Documentation for installing and using of DeepProfiler
HTML · 8 star
-
cytominer-eval
[Deprecated] Common Evaluation Metrics for DataFrames
Python · 7 star
-
cytominer-vm
[DEPRECATED] Packer scripts to create VMs for running image-based profiling workflows on a cluster
Shell · 2 star
-
Dockerfile · 1 star
-
pipeline-examples
Example pipelines for training purposes
Jupyter Notebook · 1 star
-
.github
A special GitHub repository for setting the Cytomining organization profile and default community health files.
1 star
-
profiling-template
Image-based Profiling Template
0 star
Các issue có thể đã có người làm được xếp cuối danh sách. Sắp xếp tất cả theo ngày
-
Support Python 3.13+Đang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 84/100
cytomining/copairs#145 · 1 bình luận ·
-
Feature request: export`feature_select_columns` file from `feature_select` instead of full profileĐang mở
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100
cytomining/pycytominer#759 · 1 bình luận ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
cytomining/CytoDataFrame#230 ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 52/100
cytomining/pycytominer#756 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Enable remote SQLite referencesĐang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/CytoTable#485 ·
-
NameError: Cytotable not definedĐang mở
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100
cytomining/CytoTable#476 · 3 bình luận ·
-
Deprecating legacy APIĐang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
cytomining/pycytominer#705 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100
cytomining/CytoTable#454 · 1 bình luận ·
-
Delete plotly dependencyĐang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
cytomining/copairs#129 ·
-
enhancement
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
cytomining/pycytominer#667 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Fix broken pypi deployĐang mở
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
cytomining/CytoDataFrame#211 ·
-
enhancement question
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/pycytominer#660 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/CytoTable#437 · 5 bình luận · 1 reaction ·
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/coSMicQC#329 ·
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100
cytomining/coSMicQC#328 ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 82/100
cytomining/pycytominer#646 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 52/100
cytomining/pycytominer#645 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 38/100
cytomining/CytoDataFrame#207 ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/CytoTable#430 ·
-
question
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100
cytomining/CytoTable#425 · 5 bình luận ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 20/100
cytomining/CytoDataFrame#205 ·
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 38/100
cytomining/pycytominer#635 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
enhancement
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/pycytominer#633 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/CytoDataFrame#197 ·
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 30/100
cytomining/CytoDataFrame#196 ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/CytoDataFrame#194 ·
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
cytomining/CytoDataFrame#193 ·
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100
cytomining/pycytominer#625 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/pycytominer#624 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Enable the use of arbitrary filepaths or arrays for use in image rendering with CDF instantiationĐang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/CytoDataFrame#184 ·
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
cytomining/coSMicQC#304 ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100
cytomining/CytoTable#409 ·
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 30/100
cytomining/CytoDataFrame#176 ·
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 58/100
cytomining/copairs#121 · 2 bình luận ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/CytoDataFrame#163 ·
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/CytoDataFrame#158 ·
-
Handle multi-channel imagesĐang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
cytomining/CytoDataFrame#155 ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
cytomining/CytoDataFrame#154 ·
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100
cytomining/copairs#105 ·
-
enhancement
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
cytomining/coSMicQC#268 · 1 bình luận ·
-
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 52/100
cytomining/copairs#102 ·
-
Fail to summarize across plateĐang mở
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/CytoTable#377 · 3 bình luận · 1 reaction ·
-
Can't run examplehumanĐang mởquestion
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/CytoTable#374 · 7 bình luận ·
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100
cytomining/CytoDataFrame#138 ·
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
cytomining/CytoTable#371 ·
-
question
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100
cytomining/CytoTable#362 · 6 bình luận ·
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 30/100
cytomining/pycytominer#576 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/coSMicQC#254 ·
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100
cytomining/pycytominer#574 · 3 bình luận ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
New CytoTable preset?Có thể làm lại được @d33bs đã nhận 391 ngày trước và không có pull request nào đang mở. Đang mở
cytomining/CytoTable#358 · 2 bình luận · 1 người được giao ·
Đang hiển thị 100 mục mới nhất
Trang này chỉ liệt kê những gì được lập chỉ mục gần đây. Bộ lọc nâng cao có toàn bộ kho, thu hẹp theo ngôn ngữ, độ khó và thời lượng.