Missing sidechain of target in output
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Evaluación
- Dificultad
- 4/5
- Tiempo estimado
- 3-5 días
- Aptitud para principiantes
- 25/100
- Tipo de issue
- Error
- Claridad
- Necesita aclaración
- Estado de actividad
- Estancado
- Stack tecnológico
- python
Línea de trabajo
No file, test, or entry point is named. Start by reproducing the reported RFdiffusion output and inspecting the target representation in the resulting PDB; done means determining whether the missing sidechains are expected and documenting the recommended workflow for visualizing a complete complex.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Hi community,
I am using RFdiffusion to design a binder for a target protein. After running the process, I've noticed that in the output PDB file, my target protein is only represented by its backbone (the sidechains are missing).
Is this the expected behavior?
What is the recommended workflow to visualize the final complete complex?
Thanks!
- Lenguaje dominante
- Python
- Estrellas
- 3.1k
- Forks
- 650
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Preparar el entorno
Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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