Missing sidechain of target in output
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Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 25/100
- Tipo di issue
- Bug
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Ferma
- Stack tecnologico
- python
- Ambito
- bioinformatics, machine-learning
Direzione di ricerca
No file, test, or entry point is named. Start by reproducing the reported RFdiffusion output and inspecting the target representation in the resulting PDB; done means determining whether the missing sidechains are expected and documenting the recommended workflow for visualizing a complete complex.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Hi community,
I am using RFdiffusion to design a binder for a target protein. After running the process, I've noticed that in the output PDB file, my target protein is only represented by its backbone (the sidechains are missing).
Is this the expected behavior?
What is the recommended workflow to visualize the final complete complex?
Thanks!
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 3.1k
- Fork
- 650
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
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