Missing sidechain of target in output
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Évaluation
- Difficulté
- 4/5
- Temps estimé
- 3-5 jours
- Accessibilité débutants
- 25/100
- Type d'issue
- Bug
- Clarté
- À clarifier
- Activité
- À l'abandon
- Stack technique
- python
- Domaine
- bioinformatics, machine-learning
Piste de recherche
No file, test, or entry point is named. Start by reproducing the reported RFdiffusion output and inspecting the target representation in the resulting PDB; done means determining whether the missing sidechains are expected and documenting the recommended workflow for visualizing a complete complex.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Description
Hi community,
I am using RFdiffusion to design a binder for a target protein. After running the process, I've noticed that in the output PDB file, my target protein is only represented by its backbone (the sidechains are missing).
Is this the expected behavior?
What is the recommended workflow to visualize the final complete complex?
Thanks!
- Langage dominant
- Python
- Étoiles
- 3.1k
- Forks
- 656
- Métriques de merge des PR
- Aucune PR mergée en 30 j
Préparer son environnement
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Par où commencer
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