GROMACS editor after a run: internal file names, stale status, developer text
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Evaluación
- Dificultad
- 2/5
- Tiempo estimado
- 1-3 horas
- Aptitud para principiantes
- 70/100
Línea de trabajo
Empieza en ResourceUtils.C, donde se construye el nombre de archivo del content-type ecceSession_ecceMdOptimize.gro, y en GromacsInputsPanel::refresh, donde se establece la línea de estado. Revisa cómo el editor muestra el nombre del archivo adjunto y el nombre de la topología, y dónde está el texto del párrafo introductorio. Se considera terminado cuando la pestaña Inputs muestra em.gro y processed.top como adjuntos, la estado posterior a la ejecución indica que las entradas quedan fijas hasta Reset, y la introducción conserva solo sus dos primeras oraciones.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Seen 2026-10-15 in the GROMACS MD Optimize editor after a finished minimisation (Inputs tab, read only).
- Starting structure shows ecceSession_ecceMdOptimize.gro, a name built from the content type (ResourceUtils.C), instead of the attached file's name (em.gro). The editor should keep showing the name the user attached.
- Status line still reads "Ready: a topology and a starting structure are attached." (GromacsInputsPanel::refresh). After a run it should say the calculation has run and its inputs are fixed until Reset.
- Topology shows processed.gmxtop, the internal storage name; show processed.top, as attached.
- The intro paragraph includes developer detail ("A topology is kept as .gmxtop so it cannot be mistaken for an NWChem topology; the job still sees it as topol.top."). Keep the first two sentences.
For the GROMACS round, with #334.
- Lenguaje dominante
- C
- Estrellas
- 10
- Forks
- 8
- Merge medio
- 21 min
- PR fusionados (30 d)
- 1
Preparar el entorno
Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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