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Summation of ConstantArray of 0 with vector of 0's fails

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Evaluación

Dificultad
3/5
Tiempo estimado
1-2 días
Aptitud para principiantes
45/100
Tipo de issue
Error
Claridad
Bastante claro
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
r
Área
data

Línea de trabajo

Reproduce el caso de valor cero comenzando con DelayedArray::ConstantArray y el punto de entrada HDF5Array::writeHDF5Array; luego compáralo con las combinaciones que funcionan mostradas en el informe. Se considera terminado cuando el ConstantArray de ceros más el vector de ceros se puedan escribir correctamente, y los ejemplos existentes sirvan como comprobaciones de regresión.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

Hi,

I ran into a curious edge case, where summing a ConstantArray with a vector fails if both are zero and then writing it with HDF5Array::writeHDF5Array, but not in any other combination:

mat <- DelayedArray::ConstantArray(c(2, 4), value = 0)
res <- mat + rep(0, 2)
res
#> <2 x 4> sparse DelayedMatrix object of type "double":
#>      [,1] [,2] [,3] [,4]
#> [1,]    0    0    0    0
#> [2,]    0    0    0    0
HDF5Array::writeHDF5Array(res)
#> Error in .Arith_SVT1_v2(.Generic, e1, e2): "+" is not supported between a SparseArray object and a numeric vector
#>   (result wouldn't be sparse in general)

# All other combination seems to work
mat <- DelayedArray::ConstantArray(c(2, 4), value = 0)
res <- mat + rep(3, 2)
HDF5Array::writeHDF5Array(res)
#> <2 x 4> HDF5Matrix object of type "double":
#>      [,1] [,2] [,3] [,4]
#> [1,]    3    3    3    3
#> [2,]    3    3    3    3

mat <- DelayedArray::ConstantArray(c(2, 4), value = 17)
res <- mat + rep(0, 2)
HDF5Array::writeHDF5Array(res)
#> <2 x 4> HDF5Matrix object of type "double":
#>      [,1] [,2] [,3] [,4]
#> [1,]   17   17   17   17
#> [2,]   17   17   17   17

mat <- DelayedArray::ConstantArray(c(2, 4), value = 0)
res <- mat + 0
HDF5Array::writeHDF5Array(res)
#> <2 x 4> sparse HDF5Matrix object of type "double":
#>      [,1] [,2] [,3] [,4]
#> [1,]    0    0    0    0
#> [2,]    0    0    0    0

Created on 2025-03-05 with reprex v2.1.1

I am not actually 100% this is an DelayedArray issue or if it might rather need to be moved to HDF5Array.

Best,
Constantin

Lenguaje dominante
R
Estrellas
29
Forks
12
Sin PR fusionados en 30 d

Guía de contribución

No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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