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53 indexierte Repositories · Auf GitHub ansehen
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bioformats
Bio-Formats is a Java library for reading and writing data in life sciences image file formats. It is developed by the Open Microscopy E...
Java · 429 Sterne
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ome-zarr-py
Implementation of next-generation file format (NGFF) specifications for storing bioimaging data in the cloud.
Python · 258 Sterne
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openmicroscopy
OME (Open Microscopy Environment) develops open-source software and data format standards for the storage and manipulation of biological ...
Java · 222 Sterne
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ngff
Next-generation file format (NGFF) specifications for storing bioimaging data in the cloud.
Python · 171 Sterne
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napari-ome-zarr
A napari plugin for zarr backed OME-NGFF images
Python · 54 Sterne
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napari-omero
Browse your OMERO database from within napari.
Python · 40 Sterne
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omero-py
Python project containing Ice remoting code for OMERO
Python · 28 Sterne
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omero-web
Django-based OMERO.web client
Python · 24 Sterne
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omero-documentation
Sphinx-based documentation for the Open Microscopy Environment
Python · 24 Sterne
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Python · 22 Sterne
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omero-figure
An OMERO.web app for creating Figures from images in OMERO
JavaScript · 22 Sterne
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ome2024-ngff-challenge
Project planning and material repository for the 2024 challenge to generate 1 PB of OME-Zarr data
Python · 21 Sterne
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omero-ms-zarr
Experimental micro-service for implementing the Zarr spec over HTTP
Java · 21 Sterne
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omero-iviewer
An OMERO.web app allowing to view images
JavaScript · 20 Sterne
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omero-cli-transfer
An OMERO CLI plugin for creating transfer packets between OMERO servers.
Python · 19 Sterne
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devspace
Continuous integration tool for OME projects
Shell · 19 Sterne
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omero-server-docker
OMERO.server production docker image
Shell · 17 Sterne
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ome-model
OME model (specification, code generator, implementation)
XSLT · 17 Sterne
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ngff-spec
Next-generation file format (NGFF) specifications for storing bioimaging data in the cloud.
Python · 14 Sterne
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ome-ngff-validator
Web page for validating OME-NGFF files
Svelte · 12 Sterne
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100
ome/ome-zarr-py#673 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 65/100
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
ome/ome-zarr-py#672 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100
ome/ome-zarr-py#670 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100
ome/ome-zarr-py#669 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
ome/napari-ome-zarr#170 ·
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
ome/ome-zarr-py#666 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 62/100
ome/ome-zarr-py#665 · 2 Kommentare ·
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 30/100
ome/ome-zarr-py#664 ·
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100
ome/ngff-spec#212 · 1 Kommentar ·
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 68/100
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100
ome/omero-figure#708 ·
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 38/100
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 64/100
ome/ome-zarr-py#655 ·
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Add stats on tools?Offen
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
ome/ngff#606 · 5 Kommentare · 1 Reaktion ·
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documentation rfc
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 30/100
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RFC-8 supportOffen
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
ome/ome-ngff-validator#87 ·
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 78/100
ome/ome-zarr-py#640 · 1 Kommentar ·
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 75/100
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 75/100
ome/ome-zarr-py#634 · 12 Kommentare ·
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 68/100
ome/ngff#594 · 3 Kommentare · 1 Reaktion ·
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
ome/ngff#593 · 11 Kommentare · 1 Reaktion ·
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100
ome/ngff#602 · 1 Kommentar · 2 Reaktionen ·
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infra
Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100
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Schwierigkeit 2/5 Ein halber Tag Anfängerfreundlichkeit 67/100
ome/ngff-spec#194 · 1 Reaktion ·
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
ome/ome-zarr-py#627 · 4 Kommentare ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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rfc-4
Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 72/100
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
ome/ome-common-java#119 ·
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More testsOffen
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
ome/ome-zarr-py#626 ·
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infra
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 58/100
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
ome/omero-figure#702 ·
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 68/100
ome/ngff-spec#187 · 3 Kommentare ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 1/5 Unter einer Stunde Anfängerfreundlichkeit 25/100
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 76/100
ome/omero-figure#699 · 1 Kommentar ·
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scoping
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
ome/ngff#580 · 79 Kommentare · 3 Reaktionen ·
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Migration of the Bio-Formats artifacts to Maven CentralEvtl. wieder frei @melissalinkert hat das vor 46 Tagen übernommen, und es ist kein Pull Request offen. Offen
ome/bioformats#4477 · 1 Reaktion · 2 zugewiesene Personen ·
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Build system cleanupOffen
Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 52/100
ome/ome-contributing#46 · 3 Kommentare ·
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documentation
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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BenchmarkingOffendocumentation
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
ome/ome-zarr-py#618 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 68/100
ome/bioformats#4475 ·
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 72/100
ome/bioformats#4474 ·
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 64/100
ome/bioformats#4473 ·
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 65/100
ome/bioformats#4472 ·
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 82/100
ome/bioformats#4471 ·
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 52/100
ome/bioformats#4469 ·
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