Hacktoberfest 2026: die Issues, die Maintainer für den Oktober markiert haben – offen und einsteigerfreundlich. Hacktoberfest-Issues durchsuchen

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  • Enforce share-level-only-goes-up in ClassificationModification.publish
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 68/100

    SACGF/variantgrid#2160 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • An abandoned ONGOING ClassificationImportRun stalls deferred classification work until the next import
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    SACGF/variantgrid#2159 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Sub-cohorts lose their parent's packed genotype indexes - analysis grid can show another sample's genotype
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

    SACGF/variantgrid#2155 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • nearby_tab on MT variants seq-scans the whole VTA table (transcript_id IS NULL) and blocked all 8 gunicorn workers - site down; needs short timeouts and cancel-on-disconnect
    Offen
    bug Deployment Variant Details

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

    SACGF/variantgrid#2137 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Condition matching: gene symbol highlight is always empty
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 Ein halber Tag Anfängerfreundlichkeit 66/100

    SACGF/variantgrid#2136 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Variants normalised on VCF import: search and variant page don't say so
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

    SACGF/variantgrid#2126 ·

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  • Phenotype matching: common English words match ontology terms
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 42/100

    SACGF/variantgrid#2125 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Upgrade oauthlib 3.3.1 → 4.0.0
    Offen

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 68/100

    SACGF/variantgrid#2116 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Merge symbolic variants stored below VARIANT_SYMBOLIC_ALT_SIZE into their explicit twins
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    SACGF/variantgrid#2109 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Sequencing files API: accept alignment_files (list of BAM/CRAM), keep bam_file for older clients
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 58/100

    SACGF/variantgrid#2105 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Somalier all-samples relate: --unknown pulls relatedness down ~0.17 for jointly called VCFs
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    SACGF/variantgrid#2017 · 2 Kommentare ·

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  • Linking classifications & patients/cases
    Offen
    classification

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    SACGF/variantgrid#2016 ·

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  • Support auto-sharing for VariantGrid
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    SACGF/variantgrid#2015 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Prenatal age
    Offen
    Patients

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    SACGF/variantgrid#2014 ·

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  • Homozygosity graph - improvements
    Offen
    enhancement Graph

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    SACGF/variantgrid#2012 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Patient / Sample matching page
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    SACGF/variantgrid#2011 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Patient Cohorts
    Offen
    enhancement

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    SACGF/variantgrid#2010 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • AutoComplete2 web component being complained about by Chrome
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    SACGF/variantgrid#2009 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Investigate FontAwesome Pro
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100

    SACGF/variantgrid#2008 ·

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  • Sub-Menu rework
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    SACGF/variantgrid#2007 · 1 Kommentar ·

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  • View_gene page expansion of "details" in gene version, results in misformatting of table
    Offen

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 35/100

    SACGF/variantgrid#2006 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Have Allele Info Validation re-used if the resulting variant match happens again
    Offen

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 74/100

    SACGF/variantgrid#2005 ·

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  • Proposal for scheduled annotation/ontology/clinvar update
    Offen
    can we close this?

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 15/100

    SACGF/variantgrid#2004 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Warn when imported p.HGVS differs from computed p.HGVS
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    SACGF/variantgrid#2003 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Classification History (show withdrawn duplicate records)
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    SACGF/variantgrid#2002 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Make Somatic version of graphs
    Offen
    Graph

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    SACGF/variantgrid#2001 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Download CSV link on Allele page should take into account the filtered allele origin
    Offen

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 25/100

    SACGF/variantgrid#2000 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Consider ClinVar's MedGen mapping of disease terms
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    SACGF/variantgrid#1999 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Try reporting regular 404s to Rollbar
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

    SACGF/variantgrid#1998 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Display that there are withdrawn classifications on Allele page (for users who should be able to see them)
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

    SACGF/variantgrid#1997 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Include panel name(s) in PanelAppAU extra
    Offen
    good first issue

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 58/100

    SACGF/variantgrid#1996 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Update condition auto-matching reporting to also report on the current state
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

    SACGF/variantgrid#1995 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • ImportedAlleleInfo - Matching in progress icon does not close if one genome build missing
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100

    SACGF/variantgrid#1994 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Show all GenCC relationships on HGNC page
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    SACGF/variantgrid#1993 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Add date last updated to evidence keys page
    Evtl. wieder frei Ein Pull Request dazu wurde ohne Merge geschlossen. Offen
    good first issue

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 68/100

    SACGF/variantgrid#1992 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Review use of "hide" for evidence
    Offen

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 20/100

    SACGF/variantgrid#1991 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Apply some recommended practices to Django project
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    SACGF/variantgrid#1990 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Update Diff page to show key fields like Allele, Allele Origin etc
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 58/100

    SACGF/variantgrid#1989 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Classification - Bulk phenotype assignment
    Offen
    can we close this? Ontology Shariant

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    SACGF/variantgrid#1988 · 1 Kommentar ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • GeneGrid minor issues
    Offen
    GeneGrid

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100

    SACGF/variantgrid#1987 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Autopopulate patient phenotype
    Offen
    classification Ontology

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

    SACGF/variantgrid#1986 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Gene Lists / Test panel evidence key
    Offen
    Evidence Key Shariant

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    SACGF/variantgrid#1985 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Merge annotation runs into larger + more efficient batches
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 30/100

    SACGF/variantgrid#1984 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Patients - enhancements
    Offen
    Patients

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 42/100

    SACGF/variantgrid#1983 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Mutational Hotspots filter
    Offen

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    SACGF/variantgrid#1982 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Classification form patient phenotype
    Offen
    classification Ontology

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    SACGF/variantgrid#1981 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Patient imports - new fields
    Offen
    good first issue Patients

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 42/100

    SACGF/variantgrid#1980 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • GeneGrid clinvar entries per gene
    Offen
    GeneGrid

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    SACGF/variantgrid#1979 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Search engine optimisation
    Offen

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    SACGF/variantgrid#1978 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Track what version of code was used for VariantClassificationModification
    Offen
    classification

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    SACGF/variantgrid#1977 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

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