Hacktoberfest 2026 : les issues que les mainteneurs ont marquées pour octobre, ouvertes et accessibles aux débutants. Parcourir les issues Hacktoberfest

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  • nearby_tab on MT variants seq-scans the whole VTA table (transcript_id IS NULL) and blocked all 8 gunicorn workers - site down; needs short timeouts and cancel-on-disconnect
    Ouverte
    bug Deployment Variant Details

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    SACGF/variantgrid#2137 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Condition matching: gene symbol highlight is always empty
    Ouverte

    Difficulté 3/5 Une demi-journée Accessibilité débutants 66/100

    SACGF/variantgrid#2136 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Variants normalised on VCF import: search and variant page don't say so
    Ouverte

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 55/100

    SACGF/variantgrid#2126 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Phenotype matching: common English words match ontology terms
    Ouverte

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 42/100

    SACGF/variantgrid#2125 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Upgrade oauthlib 3.3.1 → 4.0.0
    Ouverte

    Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 68/100

    SACGF/variantgrid#2116 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Merge symbolic variants stored below VARIANT_SYMBOLIC_ALT_SIZE into their explicit twins
    Ouverte

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 48/100

    SACGF/variantgrid#2109 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Sequencing files API: accept alignment_files (list of BAM/CRAM), keep bam_file for older clients
    Ouverte

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 58/100

    SACGF/variantgrid#2105 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Somalier all-samples relate: --unknown pulls relatedness down ~0.17 for jointly called VCFs
    Ouverte

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

    SACGF/variantgrid#2017 · 2 commentaires ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Linking classifications & patients/cases
    Ouverte
    classification

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    SACGF/variantgrid#2016 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Support auto-sharing for VariantGrid
    Ouverte

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    SACGF/variantgrid#2015 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Prenatal age
    Ouverte
    Patients

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100

    SACGF/variantgrid#2014 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Homozygosity graph - improvements
    Ouverte
    enhancement Graph

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    SACGF/variantgrid#2012 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Patient / Sample matching page
    Ouverte

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100

    SACGF/variantgrid#2011 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Patient Cohorts
    Ouverte
    enhancement

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    SACGF/variantgrid#2010 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • AutoComplete2 web component being complained about by Chrome
    Ouverte

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

    SACGF/variantgrid#2009 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Investigate FontAwesome Pro
    Ouverte

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 30/100

    SACGF/variantgrid#2008 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Sub-Menu rework
    Ouverte

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

    SACGF/variantgrid#2007 · 1 commentaire ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • View_gene page expansion of "details" in gene version, results in misformatting of table
    Ouverte

    Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 35/100

    SACGF/variantgrid#2006 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Have Allele Info Validation re-used if the resulting variant match happens again
    Ouverte

    Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 74/100

    SACGF/variantgrid#2005 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Proposal for scheduled annotation/ontology/clinvar update
    Ouverte
    can we close this?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 15/100

    SACGF/variantgrid#2004 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Warn when imported p.HGVS differs from computed p.HGVS
    Ouverte

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 48/100

    SACGF/variantgrid#2003 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Classification History (show withdrawn duplicate records)
    Ouverte

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 48/100

    SACGF/variantgrid#2002 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Make Somatic version of graphs
    Ouverte
    Graph

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

    SACGF/variantgrid#2001 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Download CSV link on Allele page should take into account the filtered allele origin
    Ouverte

    Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 25/100

    SACGF/variantgrid#2000 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Consider ClinVar's MedGen mapping of disease terms
    Ouverte

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

    SACGF/variantgrid#1999 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Try reporting regular 404s to Rollbar
    Ouverte

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 55/100

    SACGF/variantgrid#1998 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Display that there are withdrawn classifications on Allele page (for users who should be able to see them)
    Ouverte

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 55/100

    SACGF/variantgrid#1997 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Include panel name(s) in PanelAppAU extra
    Ouverte
    good first issue

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 58/100

    SACGF/variantgrid#1996 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Update condition auto-matching reporting to also report on the current state
    Ouverte

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 55/100

    SACGF/variantgrid#1995 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • ImportedAlleleInfo - Matching in progress icon does not close if one genome build missing
    Ouverte

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 38/100

    SACGF/variantgrid#1994 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Show all GenCC relationships on HGNC page
    Ouverte

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100

    SACGF/variantgrid#1993 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Add date last updated to evidence keys page
    Peut-être à nouveau libre Une pull request pour cette issue a été fermée sans être fusionnée. Ouverte
    good first issue

    Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 68/100

    SACGF/variantgrid#1992 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Review use of "hide" for evidence
    Ouverte

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 20/100

    SACGF/variantgrid#1991 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Apply some recommended practices to Django project
    Ouverte

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    SACGF/variantgrid#1990 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Update Diff page to show key fields like Allele, Allele Origin etc
    Ouverte

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 58/100

    SACGF/variantgrid#1989 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Classification - Bulk phenotype assignment
    Ouverte
    can we close this? Ontology Shariant

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

    SACGF/variantgrid#1988 · 1 commentaire ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • GeneGrid minor issues
    Ouverte
    GeneGrid

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100

    SACGF/variantgrid#1987 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Autopopulate patient phenotype
    Ouverte
    classification Ontology

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 55/100

    SACGF/variantgrid#1986 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Gene Lists / Test panel evidence key
    Ouverte
    Evidence Key Shariant

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

    SACGF/variantgrid#1985 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Merge annotation runs into larger + more efficient batches
    Ouverte

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 30/100

    SACGF/variantgrid#1984 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Patients - enhancements
    Ouverte
    Patients

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 42/100

    SACGF/variantgrid#1983 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Mutational Hotspots filter
    Ouverte

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    SACGF/variantgrid#1982 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Classification form patient phenotype
    Ouverte
    classification Ontology

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    SACGF/variantgrid#1981 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Patient imports - new fields
    Ouverte
    good first issue Patients

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 42/100

    SACGF/variantgrid#1980 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • GeneGrid clinvar entries per gene
    Ouverte
    GeneGrid

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100

    SACGF/variantgrid#1979 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Search engine optimisation
    Ouverte

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100

    SACGF/variantgrid#1978 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Track what version of code was used for VariantClassificationModification
    Ouverte
    classification

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

    SACGF/variantgrid#1977 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Trio / Unknown Dad enhancement
    Ouverte

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 58/100

    SACGF/variantgrid#1976 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • GeneGrid - custom gene entry - add genes to particular list
    Ouverte
    GeneGrid

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100

    SACGF/variantgrid#1975 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

  • Proper handling of hg19 vs GRCh37 contigs + annotation
    Ouverte
    Genome Build

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 38/100

    SACGF/variantgrid#1974 ·

    Les mainteneurs répondent en général sous 1 jour

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