v2: Update validator
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Avaliação
- Dificuldade
- 5/5
- Tempo estimado
- Mais de uma semana
- Facilidade para iniciantes
- 30/100
- Tipo de issue
- Funcionalidade
- Clareza
- Precisa de esclarecimento
- Status de atividade
- Estagnada
- Stack de tecnologia
- python
- Domínio
- backend, testing-qa
Direção de pesquisa
The issue identifies validation in petab.v2 but names no files or tests. Start by locating the v2 validator and its validation tests, then separate missing-column checks from the strict-mode and deserialization decisions. Done requires an agreed scope and completion of the selected checklist items without truncated or context-poor errors.
Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.
Descrição
So far, validation in petab.v2 is too lax and validator errors aren't too pretty and are often truncated.
- Readable error message
- include sufficient context in error messages
- Check for missing columns in files
- Consider using strict mode for validating files, but be more relaxed when programmatically constructing PEtab objects
- Decide whether we need to be able to de-serialize (somewhat) incorrect PEtab problems
- Linguagem predominante
- Python
- Estrelas
- 18
- Forks
- 9
- Merge médio
- 2d 4h
- PRs com merge (30d)
- 30
Preparar o ambiente
- Sem Dockerfile nem arquivo Docker Compose
- Sem modelo de pull request
- Ler o guia de contribuição
Primeiros passos
- Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
- Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
- Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
- Abra um pull request que referencie o número da issue.
Mais de PEtab-dev/libpetab-python
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`petab_files_1to2` keeps a stale model file when converting into a non-empty output directoryAberta
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